清代從事清真餐飲業的穆斯林已經十分普遍，可以說全國各地穆斯林較集中的地方，都有清真餐館。較著名的有創辦于清初的山西太原的清和元、安徽安慶方順興筵席館，創辦于乾隆年間的陜西西安輦止坡老童家羊肉店，創辦于嘉慶年間的遼寧沈陽馬家燒麥館、河北保定馬家老雞鋪，創辦于同治年間的湖北老河口市馬悅珍餐館、河南開封馬豫興雞鴨店，創辦于光緒年間的江蘇南京蔣有記餐館、湖南長沙李合盛餐館，天津白記餃子館、北京東來順羊肉館，還有創辦于清末的西安老孫家牛羊肉泡饃館，等等。這些清真餐館分布地區廣泛，經營方法靈活，在清代全國餐飲業中頗有影響，深受各族人民歡迎。如西安輦止坡老童家的臘羊肉，色鮮味香，肉質酥松，暢銷二百余年。保定馬家老雞鋪的鹵煮雞，以醇香可口聞名，清末民初時期的達官貴人多前去品嘗。馬豫興做的熟雞，選料考究，制作精細，色澤杏黃，狀若桶形，食之肥而不膩。乾隆年間陜西渭南還出了一個穆斯林巨商趙鈞瑞，他長期寓居葉爾羌、阿克蘇從事商業活動，開了很餐館、旅店，擁有200多頭駱駝、騾馬。

    清代天津的清真菜也很馳名。明朝覆滅后，宮中一些穆斯林御廚流入天津，豐富了清真菜品，促進了天津清真菜的發展。康熙十下江南，乾隆六下江南，都曾多次駐蹕天津，對天津清真菜非常贊賞。乾隆還曾賜給廚師黃馬褂和五品頂戴花翎，并將品嘗后的清真菜“燒目魚條”賜名“官燒目魚”。從咸豐到光緒年間，天津先后開設了不少清真餐館，有北大關的恩德元，侯家后的恩德厚，東興街的恩元合，紅橋的仁記恒等，他們以爆、炒、溜、燉、燴、獨、燒等烹飪技法擅長，主要菜品有300余種，例如清燉牛肉、油爆肚仁、芫爆散旦、清炒蝦仁、燉牛舌尾等；另外還有高檔清真餐館，規模較大，店堂講究幽雅，菜品也考究。既能做全羊大菜（全羊席），也能烹制河海兩鮮，兼營烤鴨和爆烤菜、涮羊肉、涼菜和四季風味面點，店堂外懸招牌是“包辦教席、全羊大菜”，主要菜品有：八魚翅、一品宮燕、燒大烏參、紅燒魚唇、兩色廣肚、紅燒干貝、清蒸原桶鮑魚，海燉魚信等數百款，全羊大菜120余種配成豐盛筵席。

    清宮御膳，特別是乾隆以后的宮廷御膳，是歷代朝廷中最為豐盛的，其中的清真飲食也是規格最高的。為什么清宮里有如此豐富的清真飲食呢？原因有二：一是乾隆時期（1736－1795）是清王朝的鼎盛時期。乾隆是清王朝定都北京后的第四代皇帝，國家經過順治、康熙、雍正三朝的培植芟（shān）理，政權趨于鞏固，社會相對穩定，經濟持續發展。宮廷御膳中的筵席規模之大和烹調技術水平之高是前所未有的。乾隆執政時，出于政治需要和游樂享受的雙重目的，經常巡游各地。所到之處，都要尋求天下美味，一時宮廷膳事盛況空前。這些民間肴饌中，不乏清真菜點小吃。很多民間清真小吃被引入宮中，經過口味調整和烹制再加工，成為宮廷名吃，然后又流行于市，有力地推動了民間地方小吃的發展。二是乾隆最寵愛的香妃是一個穆斯林。香妃是維吾爾族，1760年（乾隆二十五年）香妃因家族有功而被召進京，時年26歲。隨同進京而住在宮外的還有香妃的哥哥、叔叔、侄子等一些親屬。香妃進宮后，備受乾隆皇帝的寵愛，不久就由貴人升為嬪，繼而又晉升為容妃。乾隆皇帝十分尊重香妃的生活習慣和宗教信仰，專門在宮中配備了一名叫努伊瑪特的維吾爾族廚師為香妃做飯。香妃最愛吃的家鄉飯有“谷倫杞”（抓飯）、“滴非雅則”（洋蔥炒的菜）等。據清宮御膳譜載：“乾隆四十四年八月十五日，勤政殿進早膳，用折疊膳桌擺油香一品（賞容妃）。”大家知道，油香是伊斯蘭教傳統食品，香妃喜歡吃，就命御膳房制作，逐成為宮廷御點。香妃深得乾隆寵愛，在宮中享有特殊的地位。當她還是貴人的時候，皇帝賜給她的新疆哈密爪等貢品就比一般妃嬪為多。皇帝賜給她的御膳也都是清真的羊肉、雞、鴨和素菜等。乾隆皇帝南巡蘇州、杭州，東巡泰山、曲阜，香妃都是隨侍在則的除皇后外的幾個妃嬪之一。他們所到之處，都要尋求清真飲食美味，這樣從客觀上促使了當地清真飲食的發展和繁榮。

    清真宴席全羊席是繼滿漢全席之后的宮廷大宴席之一，為宮廷招待穆斯林客人的最高檔次宴席。全羊席是用整個羊的各個不同部位，烹制出各種不同品名、不同口味的菜肴。也就是說，從頭至腳，每一處都能做出一個菜。例如羊耳朵，可分上、中、下三段，三處可做出三樣不同的菜肴：羊耳尖可做“迎風扇”，羊耳中段可做“雙鳳翠”，羊耳根可做“龍門角”等等，品種五花八門，名稱各有千秋。而且從頭至尾，在所有的菜名中不露一個“羊”字，全都以美麗、生動、形象的別名代之。全羊席的餐室很注重伊斯蘭特色，桌布要用藍色，還要用白布縫上“清真”二字。另外，清宮中的很多清真菜肴，現在仍為清真飯店所保留，例如：它似蜜、桂花羊肉、蔥爆羊肉、芝麻里脊、炸牛排、鍋燒雞、鹽爆散丹等。還有一大批宮廷清真小吃在民間流傳，如涼糕、撒糕、切糕、甑兒糕、芙蓉糕、蜂糕等。同治年間回民起義失敗后，使西北清真飲食業受到極大的破壞。整個陜西僅有西安城內的清真餐館和流動商販尚有一些生息。西安穆斯林擅長小吃制作，特別以烹制牛羊肉泡饃、臘牛羊肉而名聞全國。較完整地保留了傳統清真飲食風味，且以用料考究，制作精細，甜咸葷素，品種眾多，為全國清真小吃之冠。

    清末到民國時期，由于經濟的發展和社會的需要，清真菜在北京得到了很大的發展和推廣。當時先后在前門外開設的羊肉館有：元興堂、又一村、兩益軒、同和軒、同益軒、西域館、西圣館、慶宴樓、萃芳園、暢悅樓、又一順、同居館（餡餅周）、東恩園居（穆家寨炒疙瘩）等。在長安街的有西來順，在中山公園的有瑞珍厚，在長安市場的有東來順。清真館過去不講究湯水，調味偏重，用芡過多。到此時則吸收了一些山東及江南烹調的基本方法，用牛肉和雞鴨吊湯，力求原汁原味，純正不膻。口味的濃厚清淡，因菜而異，形成了北京清真菜的特殊風味。

    這個時期，天津清真菜也發展到鼎盛時期，陸續出現了經營高檔清真菜的“十二樓”，如永無德、慶興樓、鴻賓樓、會芳樓、會賓樓、迎賓樓、同慶樓、大觀樓、賓宴樓、燕春樓、暢賓樓、富貴樓和又一春等。天津清真餐飲業還向兄弟地區輸送大批烹飪人才。創建于清咸豐三年（1853年）的鴻賓樓1955年整體遷至北京，成為北京最大的天津清真風味飯莊。此外還先后派出多批穆斯林廚師支援太原、石家莊、蘭州、東北等地。