3、提高逆轉(zhuǎn)錄保溫溫度
較高的保溫溫度有助于RNA二結(jié)構(gòu)的打開,增加了反應(yīng)的產(chǎn)量。對(duì)于多數(shù)RNA模板,在沒(méi)有緩沖液或鹽的條件下,將RNA和引物在65℃保溫,然后迅速置于冰上冷卻,可以消除大多數(shù)二結(jié)構(gòu),從而使引物可以結(jié)合。
4、促進(jìn)逆轉(zhuǎn)錄的添加劑
包括甘油和DMSO在內(nèi)的添加劑加到*鏈合成反應(yīng)中,可以減低核酸雙鏈的穩(wěn)定并解開RNA二結(jié)構(gòu),多可以加入20%的甘油或10%的DMSO而不影響SuperScriptⅡ或M-MLV的活性。AMV也可以耐受多20%的甘油而不降低活性。
5、RNaseH處理
在PCR之使用RNaseH處理cDNA合成反應(yīng)可以提高靈敏度。對(duì)于某些模板,在cDNA合成反應(yīng)中的RNA會(huì)阻止擴(kuò)增產(chǎn)物的結(jié)合,在這種情況下,RNaseH處理可以增加靈敏度。一般當(dāng)擴(kuò)增較長(zhǎng)的全長(zhǎng)cDNA目標(biāo)模板時(shí),RNaseH處理是必需的,比如低拷貝的tuberous scherosisⅡ。對(duì)這種困難模板,RNaseH的處理加強(qiáng)了SuperScriptⅡ或AMV合成的cDNA所產(chǎn)生的信號(hào)。對(duì)于多數(shù)RT-PCR反應(yīng),RNaseH處理是可選的,因?yàn)?5℃保溫的PCR變性步驟一般會(huì)將RNA:DNA復(fù)合物中的RNA水解掉。