4. 擴增產物出現多條帶 (雜帶)
(1)引物用量偏大,引物的特異性不高。應調換引物或降低引物的使用量。
(2)循環的次數過多。適當增加模板的量,減少循環次數。
(3)酶的用量偏高或酶的質量不好,應降低酶量或調換另一來源的酶。
(4)退火溫度偏低,退火及延伸時間偏長。應提高退火溫度,減少變性與延伸時間,也可采用二種溫度的PCR擴增。以2度為梯度設計梯度PCR反應優化退火溫度。
(5)樣品處理不當。
(6)Mg2+濃度偏高,因適當調整Mg2+使用濃度。
(7)若為PCR試劑盒,也可能時試劑盒本身質量有問題。
(8)復制提前終止。使用非熱啟動的聚合酶時常有發生。冰上準備反應體系或采用熱啟動聚合酶。
(9)反應緩沖液未全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化全并徹底混勻。
(10)引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。
(11)引物量過多。減少反應體系中引物的用量。
(12)模板量過多。質粒DNA的用量應<50ng,而基因組DNA則應<200ng。
(13)外源DNA污染。確保操作的潔凈。