4. 擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)多條帶 (雜帶)
(1)引物用量偏大,引物的特異性不高。應(yīng)調(diào)換引物或降低引物的使用量。
(2)循環(huán)的次數(shù)過(guò)多。適當(dāng)增加模板的量,減少循環(huán)次數(shù)。
(3)酶的用量偏高或酶的質(zhì)量不好,應(yīng)降低酶量或調(diào)換另一來(lái)源的酶。
(4)退火溫度偏低,退火及延伸時(shí)間偏長(zhǎng)。應(yīng)提高退火溫度,減少變性與延伸時(shí)間,也可采用二種溫度的PCR擴(kuò)增。以2度為梯度設(shè)計(jì)梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。
(5)樣品處理不當(dāng)。
(6)Mg2+濃度偏高,因適當(dāng)調(diào)整Mg2+使用濃度。
(7)若為PCR試劑盒,也可能時(shí)試劑盒本身質(zhì)量有問(wèn)題。
(8)復(fù)制提前終止。使用非熱啟動(dòng)的聚合酶時(shí)常有發(fā)生。冰上準(zhǔn)備反應(yīng)體系或采用熱啟動(dòng)聚合酶。
(9)反應(yīng)緩沖液未全融化或未充分混勻。確保反應(yīng)緩沖液融化全并徹底混勻。
(10)引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計(jì)引物。
(11)引物量過(guò)多。減少反應(yīng)體系中引物的用量。
(12)模板量過(guò)多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50ng,而基因組DNA則應(yīng)<200ng。
(13)外源DNA污染。確保操作的潔凈。