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(1)柱子在裝卸、更換時，動作要輕，接頭擰緊要適度。必須防止較強的機械振動，以免柱床產生空隙。
(2)如果儀器用來做常規分析，樣品種類有限，但分析次數多，則不妨為每一類常規分析配置1根專用柱，這樣有助于延長柱子的壽命。
(3)如使用柱溫控制裝置時，應注意在通入流動相后才能升溫。
(4)流動相使用前需進行脫氣處理，以免降低柱效和影響檢測等。樣品溶液需經適當的前處理及過濾，以減少柱污染和堵塞。
(5)在更換流動相種類時，應注意溶劑的互溶性，防止發生鹽析現象。
(6)柱子實際操作壓力應低于填裝時的最高壓力，最好在最高壓力一半以下。一般不超過20 593.965～29 419.95 kPa。在低壓力(≤14 709.975 kPa)的范圍使用，可使柱保持長時期的高柱效。
(7)C18色譜柱屬非極性鍵合相色譜柱，流動相的pH值應嚴格控制在2～7之間，以免損壞柱子。
(8)在完成分離分析工作之后，不應立即停機，需及時對色譜分析系統進行沖洗，一般0.5 h以上，以除去色譜柱內的雜質。
(9)如果流動相中有鹽類，首先用水充分清洗。如果是胺類(如三甲胺類或四丁基胺類)添加到流動相中，要用50%甲醇和0.05%磷酸溶液混合溶劑沖洗，不要只用水沖洗。
(10)C18一般用100%甲醇作為保存溶劑，以防柱子干裂而損壞。嚴禁水或緩沖溶液長時間在色譜流路中保留。
(11)選用合適的C18保護柱，以保護分析柱免受雜質顆粒及不可逆吸附的干擾物的影響。保護柱內裝填料顆粒度應與分析柱填料的顆粒度盡量一致。
(12)柱的保存期不宜太長。短期不用的C18柱，用甲醇沖洗30～60 min，然后將柱兩端密封。較長期不用的柱子，一是采取定期沖洗，再密封的方法；二是在沖洗后，柱兩端各裝1只有一定容量的灌滿甲醇的容器(只裝一端也可)，以補充在較長存放期間柱內溶劑的蒸發。
三、C18柱的維修
色譜柱在日常使用過程中，盡管保護嚴格，樣品和流動相盡管經過前處理，但經過長時間的使用，仍然難以完全避免柱子受到污染，固定相流失、板結、柱床塌陷以及柱效下降等。有些可以通過維修，使部分柱效恢復。
3.1 柱污染再生技術
色譜柱污染后，可以用合適的溶劑沖洗，使柱效再生。C18柱常規的再生洗滌方法是：分別用甲醇、三氯甲烷、甲醇/水各60 mL依次通過色譜柱，再用100%甲醇60 mL平衡色譜柱后封存，柱效將恢復正常。必要時，根據柱污染性質(如有機污染、鹽類污染等)，采用0.05 mol/L H2SO4、0.5 mol/L H3PO4或0.1 mol/L EDTA鈉鹽沖洗，然后再用水沖洗，最后用100%甲醇平衡色譜柱后封存。對于嚴重污染的C18柱，可采用水、甲醇、氯仿、乙烷依次沖洗后，按順序倒過來再沖洗1次，每次所用溶劑60 mL，不接檢測器，最后用100%甲醇平衡色譜柱封存。
3.2 柱污染的修復
在柱污染再生無效或已知柱污染嚴重時，可以采用柱修補的方法解決，但柱污染深度不宜超過5 mm。方法是將特制小鏟將污染部分挖去，再用與柱填料相同的固定相與流動相混合制成漿狀，然后將漿狀固定相仔細補入被挖去的部分(盡量使后填補的固定相接近原裝的緊密程度)，修平端面即可。修好的柱子如果柱頭兩端的篩板的孔徑是一致的，可將柱子顛倒過來使用一般時間，目的是借助流動相沖洗作用，恢復柱床緊密程度。
3.3 柱塌陷的修復
柱塌陷的原因很多。對于塌陷不太嚴重時，如果柱頭兩端的篩板孔徑是一致的，可將柱顛倒使用一般時間，即可恢復性能。當塌陷嚴重(5mm左右)時，可采用柱污染的修復方法修補即可。
