不同的食品工廠由于產品種類不同, 故污染的霉菌種類也有所差異。共同的污染源可能來自于水、通風良否、操作人員與食品原料。

1清潔生產車間的內部工具

保持生產車間內部工具的清潔和衛生，特別要注意一些衛生死角，要嚴格的檢查清理，每半個月需要深度清潔一次。如操作案面的背面，天花板、墻壁、制冷風機的衛生清理，清理衛生后所有的墻壁、天棚、設備、器具、案面表面要用酒精擦兩遍以上，尤其注意清理制冷風機的散熱片和冷氣的出風口以及內部電機葉片，這是一個很容易忽視的角落。

 

2控制生產車間的溫度和濕度

由于生產車間的溫度過高或者濕度過高，都會促使霉菌的加速生長，因此，為了更好地抑制霉菌的生長，車間的溫度需要控制在24度以下，濕度需要控制在55%以下。

3對生產車間內部空氣進行消毒

一個細菌在24小時內會繁殖成百上千甚至上百萬細菌，因此，不管是白天還是黑夜，都要對車間內的空氣消毒。白天可以采用動態空氣消毒設備對空氣消毒，晚上工人下班后可以采用臭氧或者紫外線對空氣消毒，這樣可以防止空氣中滋生細菌累加到白天，造成對產品不利。

4對生產車間內部工具進行消毒

每天班前、班后對車間內部墻壁、風機、下水道、案面、手部、圍裙套袖、預冷庫和庫門、速凍庫門、包裝室、工器具消毒間使用75%的酒精噴灑消毒，班中每2小時對風機、墻壁、下水道實施75%的酒精噴灑，殺滅菌。

5對工作人員的服裝進行清洗和殺菌

人員的工作服、更衣室等，必須保持衛生清潔，定期清洗和進行紫外線或臭氧殺菌30分鐘以上，防止人為造成霉菌的交叉污染（不可在有人情況下殺菌）。

6對生產車間內需要保持空氣流通

保證車間風機的正常運轉，保證車間內部空氣能夠達到要求指標，空調的換氣程度好壞直接影響到霉菌的產生。如果車間能保證及時將含有大量水份的空氣排出車間，則極大程度縮小了可能存在霉菌的可能性。若是有條件的廠家，建議在新回風管道內安裝動態殺菌裝置，防止管道內壁、過濾器及空調表冷器滋生細菌，給食品安全形成衛生隱患。