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菌株是微生物實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)工作中不可缺少的重要生物資源，常用于培養(yǎng)基驗(yàn)收、試驗(yàn)對(duì)照、人員培訓(xùn)考核、方法確認(rèn)等方面的質(zhì)量控制。因此為了確保工作菌株的生物特性和純度、實(shí)現(xiàn)工作菌株方便快捷的使用及溯源，菌種的相關(guān)管理工作在微生物實(shí)驗(yàn)室就顯得尤為重要，按統(tǒng)一操作程序制備的菌株是微生物試驗(yàn)結(jié)果一致性的重要保證。今天小編就“微生物實(shí)驗(yàn)室菌株管理及使用”主題和大家做一個(gè)交流分享。
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菌株管理及相關(guān)概念
標(biāo)準(zhǔn)菌株：即0代菌種，是指從官方菌種保藏機(jī)構(gòu)獲得并至少定義到屬或種的水平的菌株。實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)準(zhǔn)菌株應(yīng)有明確來源。
標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備菌株：從國(guó)內(nèi)或國(guó)外菌種保藏機(jī)構(gòu)獲得的標(biāo)準(zhǔn)菌株經(jīng)過復(fù)活并在適宜的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)后，即為標(biāo)準(zhǔn)貯備菌株。
儲(chǔ)存菌株：儲(chǔ)存菌株通常從凍干或超低溫保存的標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)存菌株進(jìn)行制備。
工作菌株：標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備菌株或儲(chǔ)存菌株經(jīng)繼代培養(yǎng)后得到的菌株。工作菌株不可替代標(biāo)準(zhǔn)菌株。
標(biāo)準(zhǔn)培養(yǎng)物：標(biāo)準(zhǔn)菌株、標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備菌株、工作菌株的統(tǒng)稱。
商業(yè)派生菌株：即用型與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)衍生物。常見的有定量工作菌株。
藥品微生物檢驗(yàn)用的試驗(yàn)菌應(yīng)為有明確來源的標(biāo)準(zhǔn)菌株，或使用與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)派生菌株。
標(biāo)準(zhǔn)菌株應(yīng)來自認(rèn)可的國(guó)內(nèi)或國(guó)外菌種保藏機(jī)構(gòu)。中國(guó)藥典2020版以及國(guó)標(biāo)中涉及的菌株主要來自于兩大菌種保藏中心：中國(guó)醫(yī)學(xué)細(xì)菌保藏管理中心（CMCC）、美國(guó)標(biāo)準(zhǔn)菌種保藏中心（ATCC）。
菌株購(gòu)買前需根據(jù)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)需求制定采購(gòu)計(jì)劃，經(jīng)審批后，向認(rèn)可的國(guó)內(nèi)或國(guó)外的菌種保藏機(jī)構(gòu)購(gòu)買標(biāo)準(zhǔn)菌株。標(biāo)準(zhǔn)菌株到達(dá)實(shí)驗(yàn)室后，菌種管理人應(yīng)檢查其名稱、數(shù)量以及每一支的完整性，同時(shí)將菌種的所有信息填寫記錄（包括菌種名稱、編號(hào)、數(shù)量、代數(shù)、來源、接收日期、接收人等），并將其貯存在規(guī)定溫度的冰箱里。
標(biāo)準(zhǔn)菌株的復(fù)蘇、復(fù)壯或培養(yǎng)物的制備應(yīng)按供應(yīng)商提供的說明或按已驗(yàn)證的方法進(jìn)行。復(fù)蘇、復(fù)壯應(yīng)選擇營(yíng)養(yǎng)成分豐富且全面的培養(yǎng)基（例如：TSA/TSB/NA/NB/SDB/SDA等），一般不使用選擇性較強(qiáng)的培養(yǎng)基；特殊的一些菌株在普通的培養(yǎng)基上生長(zhǎng)不好，可能還需添加生長(zhǎng)因子。
標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備菌株應(yīng)進(jìn)行純度和特性確認(rèn)。純度確認(rèn)包括：平板劃線查看菌落形態(tài)、革蘭氏染色、顯微鏡觀察菌體形態(tài)等；關(guān)鍵特性確認(rèn)可選擇：特征生化反應(yīng)確認(rèn)、試劑盒鑒定、菌種鑒定儀鑒定等。需要注意的是，從開啟、復(fù)蘇、復(fù)壯到純度和特性的確認(rèn)，都應(yīng)做好實(shí)驗(yàn)記錄。
標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備菌株保存時(shí)，可將培養(yǎng)物等份懸浮于抗冷凍的培養(yǎng)基中，并分裝于小瓶中，藥典建議采用低溫冷凍干燥、液氮貯存、超低溫冷凍（低于-30℃）等方法保存。低于-70℃或低溫冷凍干燥方法可以延長(zhǎng)菌種保存時(shí)間。菌種應(yīng)設(shè)專人管理，菌種保藏的地點(diǎn)應(yīng)采取一定的措施使非管理者不能輕易獲取，例如加鎖保管，雙人保管等。
標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備菌株可用于制備每月或每周1次轉(zhuǎn)種的工作菌株。冷凍菌種一旦解凍轉(zhuǎn)種制備工作菌株后，不得重新冷凍和再次使用。
從保藏機(jī)構(gòu)獲取的凍干菌種為0代菌種，每轉(zhuǎn)接一次增加一代（1代是指將活的培養(yǎng)物接種到微生物生長(zhǎng)的新鮮培養(yǎng)基中培養(yǎng)，任何形式的轉(zhuǎn)種均被認(rèn)為傳代一次），工作菌株的傳代次數(shù)應(yīng)嚴(yán)格控制，不得超過5代，以防止過度的傳代增加菌株變異的風(fēng)險(xiǎn)。
從標(biāo)準(zhǔn)菌株制備標(biāo)準(zhǔn)儲(chǔ)備儲(chǔ)備菌株流程（GB 4789.28-2013）
工作菌株由儲(chǔ)存菌株或標(biāo)準(zhǔn)貯備菌株制備，除此之外，還可以使用可以溯源的商業(yè)派生菌株。標(biāo)準(zhǔn)菌株如果經(jīng)過確認(rèn)試驗(yàn)證明已經(jīng)老化、退化、變異、污染等或該菌株已無使用需要時(shí)，應(yīng)及時(shí)滅菌銷毀。
制備工作菌株流程圖（GB 4789.28-2013）
菌種必須定期轉(zhuǎn)種傳代，并做純度、特性等實(shí)驗(yàn)室所需關(guān)鍵指標(biāo)的確認(rèn)，實(shí)驗(yàn)室應(yīng)建立菌種管理（從標(biāo)準(zhǔn)菌株到工作菌株）的文件和記錄，內(nèi)容包括菌株的申購(gòu)、進(jìn)出、收集、貯藏、確認(rèn)、轉(zhuǎn)種、使用以及銷毀等全過程。每支菌種都應(yīng)注明其名稱、標(biāo)準(zhǔn)號(hào)、接種日期、傳代數(shù)，并記錄菌種生長(zhǎng)的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件、菌種保藏的位置和條件等信息。
有關(guān)微生物實(shí)驗(yàn)室菌株管理及使用涉及的相關(guān)法規(guī)如下，可供參考:
中國(guó)藥典2020版《9203藥品微生物實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理指導(dǎo)原則》
中國(guó)藥典2020版《9204微生物鑒定指導(dǎo)原則》
中國(guó)藥典2020版《9205藥品潔凈實(shí)驗(yàn)室微生物監(jiān)控和控制指導(dǎo)原則》
藥品生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范（2010年修訂）
CNAS-CL03-A001-2019《能力驗(yàn)證提供者認(rèn)可準(zhǔn)則在微生物領(lǐng)域的應(yīng)用說明》
CNAS-CL05-2016《實(shí)驗(yàn)室生物安全認(rèn)可規(guī)則》
GB 4789.28-2013食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗(yàn)培養(yǎng)基和試劑的質(zhì)量要求
GB/T 27405-2008 《實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品微生物檢測(cè)》
GB 4789.1-2016 食品安全國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)食品微生物學(xué)檢驗(yàn) 總則
SN/T 1538.1-2016 培養(yǎng)基制備指南 第1部分 實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)基制備質(zhì)量保證通則
SN/T 1538.2-2016 培養(yǎng)基制備指南 第2部分 培養(yǎng)基性能測(cè)試實(shí)用指南
SN/T 2660-2010 食品微生物實(shí)驗(yàn)室菌種保藏方法
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商業(yè)派生菌株
商業(yè)派生菌株是標(biāo)準(zhǔn)菌株的商業(yè)衍生物，最常見的是定量工作菌株。在中國(guó)藥典2020版9203指導(dǎo)原則里面有提到“藥品微生物檢驗(yàn)用的試驗(yàn)菌應(yīng)來自認(rèn)可的國(guó)內(nèi)或國(guó)外菌種保藏機(jī)構(gòu)的標(biāo)準(zhǔn)菌株，或使用與標(biāo)準(zhǔn)菌株所有相關(guān)特性等效的可以溯源的商業(yè)派生菌株”，USP<1117>也有關(guān)于可以使用合格的商品化菌株的描述“Cultures for use in compendial tests should be acquired from a national culture collection or a qualified secondary supplier”。隨著技術(shù)的進(jìn)步與發(fā)展，微生物實(shí)驗(yàn)室穩(wěn)定、高效的需求，用于質(zhì)控的商業(yè)化定量工作菌株的廣泛應(yīng)用定是必然趨勢(shì)。
商業(yè)派生菌株要求相關(guān)特性與標(biāo)準(zhǔn)菌株等效，除此之外，還有關(guān)鍵一點(diǎn)就是“可以溯源”。微生物"溯源"通常包含兩層意思，一是指程序、途徑合法有序，來源和去向清晰可控；另外是技術(shù)層面的佐證，比如株水平的鑒定識(shí)別等。這兩個(gè)層面互為補(bǔ)充支撐，以保證菌種準(zhǔn)確無誤、合法有效。
選擇使用商業(yè)派生菌株時(shí)，建議做好實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)菌株的差異分析和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估。綜合評(píng)估之后，選擇合適的商業(yè)派生菌株。
