噬菌體是細菌病毒的總稱。噬菌體基因組含有許多個基因，但所有已知的噬菌體都是細菌細胞中利用細菌的核糖體、蛋白質合成時所需的各種因子、各種氨基酸和能量產生系統來實現其自身的生長和增殖。一旦離開了宿主細胞，噬菌體既不能生長，也不能復制。
    噬菌體顆粒在結構上有很大差別，一般可分成三種類型，即無尾部結構的二十面體，有尾部結構的二十面體和線狀體，迄今已知的噬菌體大多數是有尾部結構的二十面體。
   噬菌體顆粒感染一個細菌細胞后可迅速生成幾百個子代噬菌體顆粒，每個子代顆粒又可感染細菌細胞，再生成幾百個子代噬菌體顆粒。如此重復只需4次，一個噬菌體顆粒便可使幾十億個細菌感染而死亡。當把細菌涂布在培養基上，長成一層菌苔時，一個噬菌體感染其中一個細菌時，便會同上面所說的那樣，把該細菌周圍的成千上萬個細菌感染致死，在培養基的菌苔上出現一個由于細菌被噬菌體裂解后造成的空斑，這便稱為噬菌斑(plaque)。每一噬菌體除了能使宿主細菌裂解死亡外，還有一些噬菌體感染細菌后，并不使細胞死亡，稱為溫和噬菌體，這些噬菌體感染細菌后，將其自身的基因組整合進宿主細胞的基因組，此時，這種宿主細菌稱為溶原性細菌。溶原性細菌內存在的整套噬菌體DNA基因組稱為原噬菌體(prophage)，溶原性細菌不會產生許多子噬菌體顆粒，也不會裂解；但當條件改變使溶原周期終止時，宿主細胞就會因原噬菌體的增殖而裂解死亡，釋放出許多子代噬菌體顆粒。
    溶原性細菌有兩個特點。第一，溶原性細菌在被噬菌體感染并溶原化后，不會被同種噬菌體再次感染，這是超感染免疫性。第二，經過若干世代后，溶原性細菌會開始進入溶菌周期，即溶原性細菌的誘發。此時，原噬菌體從宿主基因組上切離下來進行增殖。
    λ噬菌體載體不具有質粒載體的抗生素抗性的標記基因；因此，對λ重組分子的選擇主要有下面幾種方法。
    ① cI基因功能選擇  cI基因編碼的阻遏蛋白可使感染了λ噬菌體的大腸桿菌進入溶原化狀態。如果在插入型載體的克隆位點上，或是置換型載體的可置換片段中，放上一個cI基因，當外源DNA插入或取代時，便破壞了cI基因，使出現cI-表型。此時，λ重組分子生成的是透亮的噬菌斑，而未重組的λ噬菌體由于仍保有cI基因，所以宿主細菌是溶原化的，就生成混沌的噬菌斑。
    ②lac Z基因功能選擇  lac Z基因的產物為盧—半乳糖苷酶，在Xgal—IPTG培養基上顯現藍色。在插入型載體的lac Z基因序列中引入限制性內切核酸酶的切點，外源DNA插入這個克隆位點就會破壞lac Z基因，于是在上述培養基上出現無色的噬菌斑。如果沒有同外源DNA形成λ重組分子，則lac Z基因未遭破壞，在培養基上出現藍色的噬菌斑。
    ③spi-選擇  λ噬菌體的red和gam基因產物可抑制噬菌體在宿主細菌中正常生長，red-和gam-突變型λ噬菌體則可正常生長。當置換型載體的可置換片段中放上red和gam基因后，外源DNA片段取代了置換片段，則同時除去了red、gam基因，就可在宿主菌中生長，否則就不能正常生長。