部分患者病程短，恢復快，且不留后遺癥，預后良好。

部分患者病情迅速加重，出現病毒性肺炎、成人呼吸窘迫綜合征、呼吸衰竭、心衰及腎衰等多器官衰竭、敗血癥休克及Reye綜合征等多種并發癥而死亡。

從1997年香港禽流感統計資料可以看出，18例確診禽流感患者死亡6例，死亡率為33.3％。

越南10例確診患者中，有8例死亡。 可見禽流感患者的死亡率是比較高的。