大棚辣椒定植后，極易發生根腐病、青枯病和疫病，造成植株成片枯死，使產量受到嚴重影響，損失極大。為了有效地控制病害的發生，做到對癥下藥，及時防治，現將其發生癥狀及防治方法介紹如下。
一、癥狀識別
1、根腐病 一般在辣椒定植后至采果盛期發生，染病植株的枝葉白天發生萎蔫，傍晚至次日凌晨恢復，反復多日后導致整個植株枯死。觀察根部，病株的根及根莖部皮層呈淺褐色至褐色腐爛，而且易剝離，多由支根蔓延至主根。
2、青枯病 是一種細菌性病害，苗期病狀表現不明顯，定植后從主根基部開始逐步枯死，根莖的表皮不變色，縱剖根莖部維管束變成暗褐色。
3、疫病 染病后植株根莖部初呈水浸狀，后變黑褐色很快繞莖1周，病部稍縊縮，造成整個植株萎蔫枯死。在危害根莖部的同時，還危害植株的莖節分杈，一般都表現為黑褐色條形病斑，老棚連作地發生更為嚴重。
二、發病條件
以上幾種病害，一般都借灌水及農事操作傳播，進行再侵染。連年重茬栽培，致使土壤中病菌含量不斷增加，再加上棚室內高溫高濕小氣候，均有利于病害的發生，尤其在灌水和培土后，根際通氣不良，更易促成根部病害流行。
三、防治方法
1、合理輪作，科學安排茬口 前茬以十字花科、豆科蔬菜及蔥、蒜等為宜，避免與茄果類、瓜類等作物連作，減少病菌的積累。
2、加強管理 適時通風換氣，降低棚室內的濕度；澆水時采取小水澆灌或隔行澆，不可大水漫灌，杜絕田間積水；避免過早過深進行根際培土；適量增施磷鉀肥料，保證植株健壯生長，提高辣椒自身的抗病力。
3、清潔田園 經常注意觀察生長狀況，一旦發現病株要及時拔掉，帶出棚外集中燒毀，并將植株周圍的病土清除或進行灌藥處理，從而控制病菌的傳播蔓延，降低發病率。
4、藥劑防治 發病初期，及早施用對口農藥，進行灌根防治。根腐病可用50％甲基硫菌靈可濕性粉劑500倍液，或50％多菌靈可濕性粉劑600倍液，或綠亨2號500倍液。防治疫病可用50％ 甲霜銅可濕性粉劑600倍液，或50％甲霜靈錳鋅可濕性粉劑500倍液，或72．2％的普力克水劑600～800倍液。青枯病用綠乳銅600倍液，抗菌劑 401 500倍液或（100～200）×10-6的農用鏈霉素和500倍愛多收混勻澆根。一般每株藥液量200～300克，7天灌1次，連續3～4次。注意做到交替用藥，以防產生抗藥性。