無論是生產蔬菜還是花卉苗木，育苗基質都是生產高質量產品的關鍵因素。育苗基質的功能應與土壤相似，這樣植株才能更好的適應環境，快速生長。在選配育苗基質時，應遵從以下幾個標準：
1、從生態環境角度考慮。要求育苗基質基本上不含活的病菌、蟲卵，不含或盡量少含有害物質，以防其隨苗進入生長田后污染環境與食物鏈。為了符合這個標準，育苗基質應經金寶貝發酵劑快速發酵，達到殺菌殺毒、去除蟲卵的目的。
2、育苗基質應有與土壤相似的功能。從營養條件和生長環境方面來講，基質比土壤更有利于植株生長。但它仍然需要有土壤的其他功能，如利于根系纏繞(以便起坨)和較好的保水性等。。
3、育苗基質以配制有機、無機復合基質為好。在配制育苗基質時，應注意把有機基質和無機基質科學合理組配，更好地調節育苗基質的通氣、水分和營養狀況。其中的
4、選擇使用當地資源豐富、價格低廉的輕基質。在應用穴盤育苗技術時，如何選擇育苗基質是關系到育苗成本和育苗質量的首要問題。在通常情況下，應充分挖掘和利用當地適合穴盤育苗的輕基質資源，降低育苗基質成本，從而降低穴盤苗的銷售價格。根據各地實際情況，選用炭化稻殼、棉籽殼、鋸末、蛭石、珍珠巖等價格低廉基質作穴盤育苗基質。
