1、功能性食品配料
作為功能食品的提出，日本遠比西方要早。所有食品均含某些維持健康和生理機能的營養成分，但功能食品應該具有獨特的生理活性和功效。在1984年，日本文部省就在“食品機能系統的解析的拓展”中強調食品的第三功能，使用功能食品這一名稱，并推動國內廣泛的研究；在民間，由企業組成了功能食品聯絡機構。就在1990年，有一種用低聚糖和維生素C配制的功能飲料“OligoCC”，當年銷售達9000萬瓶。1991年厚生省實施營養改善法，建立自愿申報審批的特定保健用品管理辦法，把一部分功能食品納入這一范疇，但規定必須是加工食品形式，如乳制品、谷物食品飲料、調味品、糖果等，不包括像藥丸、膠囊、復合劑或其他類似于有特殊防病作用的食品，也不在其內，但功能性低聚糖配制的調整腸道幫助消化外，尚有控制血壓、中和脂肪，補充礦物質，控制血糖，降低膽固醇，防齲齒等。據日本保健和營養協會(JHNFA)報道，1999年特定保健用食品銷售總額1.824億美元，其中用低聚糖作幫助消化的特定保健食品銷售額8912萬美元，占總銷售額的4％。所使用的低聚糖品種有低聚果糖、大豆低聚糖、低聚木糖、乳果糖、乳酮糖、低聚半乳糖、低聚異麥芽糖等。所制食品有飲料、藥、餅干、布丁、發酵乳、調味醋、巧克力等。截至1999年10月，特殊保健食品已批準171種，新近批準用功能性低聚糖配制具有雙歧桿菌增殖調節腸道功能的品種有Nippon制粉用棉籽糖的湯類，Lotte用低聚木糖的糖果，EzakiGlico用乳果糖的餅干和糖果。
在歐洲，功能性低聚糖不作為食品添加劑管理，作為食品配料廣泛應用于各類食品，像Orafti低聚果糖成功應用于酸乳、飲料、乳酪、餡料、冰淇淋、焙烤、巧克力、糖果、肉制品等。如比利時的FYOS和西班牙市場的Sveltesse是含低聚果糖的乳飲料；荷蘭市場的MusliNotenreep是含低聚果糖的米粉點心prculoDomo等公司生產的低聚半乳糖，由于其熱穩定性好，能應用于乳制品，飲料、糖果、點心、冷凍甜點、面包、果醬、蜂制品、肉制品等，例如有低聚半乳糖2－4g/瓶和3－4g/100ml的清涼飲料、2－3g/100g的特制嬰兒餅干，1－4g/100g的脆米餅等。
在我國，雖然功能性低聚糖的工業化生產始自1996年，但經五年發展，已具有一定規模，年產3萬噸左右。目前大部分作為食品配料使用，從絕對消費量來看，已和目標接近。在食品工業中的應用，我國較多地應用于含乳飲料，少量用于糖果、酒類，有一部分作為保健品或保健品的配料上市，有很多食品還沒有涉及。總的來說，應用的品種較少，即使用得較多的飲料，在飲料行業中也是小品種。保健食品也是花色繁多，絕對用量較小的部門。和日本、歐洲比較，還有很多食品行業的應用尚待開發，要根據中國的國情，中國人的飲食習慣，向著能進入一日三餐的方便營養食品和滿足社會不同人群特殊食品需要的方向去努力開拓。
2、低聚糖飼料：我國飼料工業已發展成為我國工業體系中重要的支柱產業之一，已躍居世界第二大生產大國。按照1996－2020年我國飼料工業發展中、長期發展規劃，到2010年我國配合飼料的產量達到1億噸，濃縮飼料1200萬噸，預混合飼料300萬噸，對飼料添加劑的需求將大幅增加，低聚糖飼料添加劑將大有作為。
低聚糖對動物也有和人體相似的功效。自1960年以來有很多報道，但在飼料中大規模使用是近十多年的事，只是在低聚糖有了工業規模生產以及能被飼料工業接受的適當價格以后才有可能。
低聚糖添加于飼料的主要功效為：(1)促進雙歧桿菌增殖； (2)提高排便速度； (3)減少血氨濃度； 4)增進礦物質吸收； 5)增強免疫能力。
關于飼用實驗效果，現將國內外不同品中低聚糖的飼用結果列于表
此外還有不少關于低聚糖對預防沙門氏菌感染以及減少幼禽畜下痢的報道。最近，國內不少單位和低聚糖生產企業配合進行的試驗結果也確認，低聚糖作為飼料的功能性添加劑，其結果是肯定的。
3、低聚糖農藥：21世紀人類面臨的挑戰中，糧食對人類生存與發展具有重要意見。我國現在耕地占世界的7％，到2005年人口將達到13.5左右，將占世界總人口的25％。保持農業可持續發展，農藥在我國具有重要地位。
4、低聚糖新型生物農藥具有以下優點：水溶性好；對人畜無害；不污染環境；長期或多次誘導不會使植物產生特異抗病性；使用劑量低而且價格與有機農藥相近。低聚糖農藥在水果、蔬菜病害防治中的安全性也是低聚糖農藥的特色。隨著目前人們對綠色食品的需求量日趨增加，低聚糖農藥的市場將越來越大，寡聚糖生物農藥作為一類新型的植物激素及植物抗性激活因子在農作物生長發育和病蟲害防治中具有廣闊的開發前景。
5、低聚糖生化肥料：低聚糖對土壤微生物也有菌群調節作用，能提高化肥的利用率。當前，對環境的污染貢獻率已達到40％。使用生化肥料是農業領域中的向往，低聚糖素大有作為。
科學技術的進步與生物技術的發展，對人類的生活產生了重要的影響，不僅僅是社會經濟的空前繁榮，同時也有環境、健康等領域的空前壓力。低聚糖的異軍突起，已介入了醫藥、食品、飼料及農業領域，對緩解社會壓力、提高人們生活水平具有重要作用。