腦位于顱腔內，由腦干、間腦、小腦及端腦（左右大腦半球）組成。

腦干是脊髓向顱腔內延伸的部分。它下端在枕骨大孔處與脊髓相連，上端與間腦相接被大腦兩半球所覆蓋，它的背側與小腦相連。腦干自下而上又可分為延髓、腦橋、中腦三段（有人主張將間腦也列入腦干的范圍）。

延髓延髓腹面的上方以一橫溝與腦橋為界，它的下半部與脊髓外形相似，沿中線兩旁，有一對縱行隆起，稱為錐體。錐體外側有橄欖體，內有下橄欖核。錐體和橄欖體之間有舌下神經自此出腦。在延髓的側面、橄欖體的背側，從上到下有舌咽神經、迷走神經和副神經。延髓的背面，其下部與脊髓相似。其上部，由于中央管開放為第四腦室，它與腦橋背面共同形成寬大的第四腦室底，第四腦室向下通脊髓中央管，向上通中腦水管。

腦橋腦橋的腹側面是闊的隆起，稱為基底部，腦橋基底部向外逐漸變窄，稱為腦橋臂。背面與小腦相連。腦橋臂與基底部之間有三叉神經根。腦橋與延髓交界處，由內到外有外展神經，面神經和位聽神經根。

中腦中腦的腹側有一對縱行隆起，稱為大腦腳，內有粗大的縱行纖維通過。動眼神經由大腦腳內側發出。中腦背面有兩對丘形隆起，稱為四疊體，上方一對稱為上丘，下方一對稱為下丘。滑車神經在四疊體下方發出。中腦內的管腔為中腦水管，與上方的第三腦室和下方的第四腦室連通。