人的衛(wèi)星DNA 或稱隨體DNA 是由一些短的DNA 片段（10bp 左右）多次重復(fù)所構(gòu)成的。重復(fù)片段的組成和拷貝數(shù)在不同的個(gè)體及基因組的不同位置上不一樣。提取不同個(gè)體的基因組DNA 后，用其切點(diǎn)能識(shí)別序列為4 個(gè)堿基而又不切割該重復(fù)片段的限制性內(nèi)切酶在重復(fù)片段的兩側(cè)切割基因組DNA ，然后將樣品進(jìn)行凝膠電泳。不同長(zhǎng)度的重復(fù)片段（主要是由于重復(fù)單位的拷貝數(shù)不同所致）就會(huì)分開，再與含有這些重復(fù)序列的特異性探針雜交，便形成有個(gè)體特異性的放射性自顯影圖，亦稱為DNA 指紋。DNA 指紋的圖譜取決于所用探針的核心序列（即重復(fù)序列中的重復(fù)單位）。目前所用的探針有兩種，即探針33.15 。其核心序列為AGAGGTGGGCAGGTGG, 和33.6 ，即AGGGCTGGAGG 。這就是說這兩種序列在人體基因組中不同的位置上分別重復(fù)不同的次數(shù)，而在不同個(gè)體的基因組中，對(duì)應(yīng)位置上這兩種核心序列的重復(fù)次數(shù)也不相同。這樣用這兩種探針之一與合適的酶切割的人體基因組DNA 片段雜交，在不同的個(gè)體將得到不同的DNA 指紋，而且探針33.5 的DNA 指紋圖也不相同。DNA 指紋具有細(xì)胞穩(wěn)定性和種系穩(wěn)定性，是按孟德爾規(guī)律遺傳的，而且雜合性高。雜合性可以這樣來理解，對(duì)于由點(diǎn)突變引起的RFLP ，就某一個(gè)多態(tài)性切點(diǎn)來說只有兩種多態(tài)性，即切點(diǎn)有（ ）或切點(diǎn)無（- ）。而對(duì)由于高變區(qū)重復(fù)片段長(zhǎng)度不同所引起的RFLP 來說，在基因組上某一個(gè)位置核心序列的重復(fù)次數(shù)在不同的個(gè)體不一樣，比如在個(gè)體Ａ為10 個(gè)拷貝，個(gè)體Ｂ為15 個(gè)拷貝，而個(gè)體Ｃ又可能為18 個(gè)拷貝等等。因此，在不同個(gè)體同一個(gè)相應(yīng)位置上核心序列的重復(fù)次數(shù)就是多態(tài)的，而不是雙態(tài)的。即使在基因組上的某一個(gè)位置處核心序列的次數(shù)一樣，從而被酶切出的長(zhǎng)度相同，但在基因組的其他位置上該核心序列重復(fù)次數(shù)又可能不同。由于DNA 指紋是按孟德爾規(guī)律遺傳的，子代的DNA 指紋圖可以追溯到其父母DNA 指紋圖上，而在不是其父母的DNA 指紋圖上則很難找到與其一樣的小隨體DNA 片段。在父親的5 條可分辨的小隨體DNA 片段中，有4 條處于雜合狀態(tài)，即這4 條DNA 片段有不同的個(gè)體長(zhǎng)度。因此，因高變區(qū)核心序列重復(fù)次數(shù)不同引起的RLFP 才是真正的多態(tài)性。在不同個(gè)體，這種RLFP 即DNA 指紋可以說不存在相同的。即使使用一種探針產(chǎn)生的DNA 指紋圖無法鑒定這兩個(gè)個(gè)體，如再用另一種探針便有可能將這兩個(gè)個(gè)體區(qū)分開。DNA 指紋技術(shù)已被應(yīng)用于親子鑒定和法醫(yī)學(xué)上對(duì)罪犯的確認(rèn)等領(lǐng)域。