彩色 DNA 感應(yīng)器的基本原理與掃描式 DNA 感應(yīng)器類似，但其差別為所用的金納米粒子有兩種不同的直徑。研究人員研發(fā)出一種特殊的化學(xué)方法，可將與欲探測(cè)的兩種 DNA 序列互補(bǔ)的片段 DNA 予以修飾后個(gè)別連接在不同大小的金納米粒子上，其粒子直徑分別為 50 與 100 納米。其中一種 DNA（a）與 100 納米的金納米粒子連結(jié)，另外僅有一個(gè)堿基差異的相似 DNA（b）則與 50 納米的金納米粒子連結(jié)。在玻片上事先固定有單股 DNA 序列（c , d），當(dāng)此種帶有特殊序列的 DNA-金納米粒子，藉由標(biāo)的 DNA（ac , bd）分別與玻片上的單股 DNA 序列結(jié)合后，再以光照射，50 納米的金納米粒子呈現(xiàn)綠色，而 100 納米的金納米粒子則呈現(xiàn)橘色。
利用此方法，可偵測(cè)兩種不同的 DNA 序列。在較低溫度下（攝氏 45 ~ 55 度），二者均可與玻片上的 DNA 配對(duì)而呈色，但是將溫度升高至攝氏 60 度后，有差異的 DNA 片段就會(huì)因?yàn)槠渲形ㄒ坏囊粋�(gè)相異的堿基無法配對(duì)而結(jié)合力減弱，導(dǎo)致脫離，所顯現(xiàn)的綠色也因而消失。
在檢測(cè)的過程中，隨著溫度的升高，顏色隨之變化，進(jìn)而綠色消失，以肉眼即可觀察到。由此結(jié)果即可判斷，能夠與直徑為 100 納米的金納米粒子配對(duì)的標(biāo)的 DNA 與 50 納米的金納米粒子配對(duì)的另一種標(biāo)的 DNA 含有不同的序列。
這種方法目前雖只能比較兩種樣品，但是未來仍有改善的空間。可借著改變金納米粒子直徑的大小或形狀的差異，產(chǎn)生不同的顏色而增加測(cè)試種類的數(shù)目。由于其專一性極高，不但可應(yīng)用在一般的基因檢驗(yàn)上，亦可用來偵測(cè)基因的單一核酸多型性（single-nucleotide polymorphism, SNP）差異與基因突變所導(dǎo)致的疾病。所謂單一核酸多型性差異是指某些基因在同種但不同的生物個(gè)體之間，其 DNA 序列僅只有一個(gè)核酸不同，雖然差異極小，但視其基因的重要性仍會(huì)造成明顯的個(gè)體差異。例如，可能會(huì)對(duì)某些疾病特別有抵抗性或是特別易受感染。
利用此方法，可偵測(cè)兩種不同的 DNA 序列。在較低溫度下（攝氏 45 ~ 55 度），二者均可與玻片上的 DNA 配對(duì)而呈色，但是將溫度升高至攝氏 60 度后，有差異的 DNA 片段就會(huì)因?yàn)槠渲形ㄒ坏囊粋�(gè)相異的堿基無法配對(duì)而結(jié)合力減弱，導(dǎo)致脫離，所顯現(xiàn)的綠色也因而消失。
在檢測(cè)的過程中，隨著溫度的升高，顏色隨之變化，進(jìn)而綠色消失，以肉眼即可觀察到。由此結(jié)果即可判斷，能夠與直徑為 100 納米的金納米粒子配對(duì)的標(biāo)的 DNA 與 50 納米的金納米粒子配對(duì)的另一種標(biāo)的 DNA 含有不同的序列。
這種方法目前雖只能比較兩種樣品，但是未來仍有改善的空間。可借著改變金納米粒子直徑的大小或形狀的差異，產(chǎn)生不同的顏色而增加測(cè)試種類的數(shù)目。由于其專一性極高，不但可應(yīng)用在一般的基因檢驗(yàn)上，亦可用來偵測(cè)基因的單一核酸多型性（single-nucleotide polymorphism, SNP）差異與基因突變所導(dǎo)致的疾病。所謂單一核酸多型性差異是指某些基因在同種但不同的生物個(gè)體之間，其 DNA 序列僅只有一個(gè)核酸不同，雖然差異極小，但視其基因的重要性仍會(huì)造成明顯的個(gè)體差異。例如，可能會(huì)對(duì)某些疾病特別有抵抗性或是特別易受感染。