核磁共振技術可以直接研究溶液和活細胞中相對分子質量較小(20,000 道爾頓以下)的蛋白質、核酸以及其它分子的結構, 而不損傷細胞。核磁共振的基本原理是:原子核有自旋運動, 在恒定的磁場中, 自旋的原子核將繞外加磁場作回旋轉動, 叫進動(precession)。進動有一定的頻率, 它與所加磁場的強度成正比。如在此基礎上再加一個固定頻率的電磁波, 并調節外加磁場的強度, 使進動頻率與電磁波頻率相同。這時原子核進動與電磁波產生共振, 叫核磁共振。核磁共振時, 原子核吸收電磁波的能量, 記錄下的吸收曲線就是核磁共振譜(NMR-spectrum)。由于不同分子中原子核的化學環境不同, 將會有不同的共振頻率, 產生不同的共振譜。記錄這種波譜即可判斷該原子在分子中所處的位置及相對數目, 用以進行定量分析及分子量的測定, 并對有機化合物進行結構分析。