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比較項目 |
化學(xué)合成 |
體外轉(zhuǎn)錄 |
RNase III降解dsRNA |
siRNA |
PCR |
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材料需求 |
21-mer RNA |
29-mer DNA oligos(一對) |
轉(zhuǎn)錄模版 (200-1000bp，兩側(cè)帶T7 啟動子) |
55-60-mer DNA oligos(一對) |
~50-mer DNA oligos(一對) |
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全部制備/合成時間所需時間 |
4天—2周 |
24 小時 DNA oligo合成時間 |
1 天 轉(zhuǎn)錄模版制備時間 |
5天以上 DNA oligo合成時間 |
~ 6 小時 DNA oligo合成時間 |
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個人所需操作時間 |
幾乎不需要* |
中等 |
中等 |
多 |
中等 |
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是否需要驗證和尋找最有效siRNA |
需要 |
需要 |
不需要 |
需要 |
需要 |
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能否標(biāo)記siRNA (例如用于熒光顯微鏡分析siRNA進入細(xì)胞過程或者在細(xì)胞中的定位） |
能 |
能 |
能 |
不能 |
不能 |
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轉(zhuǎn)染的相對難易程度 |
好 |
好 |
好 |
差 |
差 |
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可篩選性 (例如抗生素篩選) |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以 |
不可以 |
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能否用于長效抑制 |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以（抗生素篩選） |
不可以 |
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能否大規(guī)模制備 |
可以 |
有限 |
有限 |
可以 |
有限 |
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檢測總體轉(zhuǎn)染效率 |
不可以 |
不可以 |
不可以 |
可以 |
不可以 |
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每個基因的相對費用（不包含人力） |
高 |
中等 |
低 |
中等 |
中等 |
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*取決于合成后是否包含純化、去保護，以及廠家提供的是已經(jīng)退火的即用型雙鏈還是凍干的單鏈 |
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