質粒、噬菌體等經酶切，電泳；PCR產物經電泳后，常常需要對一些DNA電泳片段進行回收和純化，用于亞克隆、探針標記等。DNA回收和純化常用方法有壓碎法、低融點瓊脂糖法、凍融法等，也有現成的試劑盒供應。
一、凍融法
1. 紫外燈下仔細切下含待回收DNA的膠條，將切下的膠條（小于0.6g）搗碎，置于1.5ml離心管中；
2. 加入等體積的Tris-HCl飽和酚（pH 7.6），振蕩混勻；
3. -20℃放置5-10min；
4. 4℃離心10000g×5min，上層液轉移置另一離心管中；
5. 加入1/4體積H2O于含膠的離心管中，振蕩混勻；
6. -20℃，放置5-10min；
7. 4℃離心10000g×5min，合并上清液；
8. 用等體積酚/氯仿、氯仿分別抽提一次，取上清；
9. 加入1/10體積3M NaAc（pH 5.2）、2.5倍體積預冷的無水乙醇，混勻；
10. -20℃，靜置30min；
11. 4℃離心13000g×10min，棄上清，75%乙醇洗沉淀1-2次，晾干；
12. 加適量H2O或TE溶解沉淀。
二、DNA回收試劑盒（QIAquick Gel Extraction Kit Protocol）
1. 紫外燈下仔細切下含待回收DNA的凝膠，置1.5ml離心管中，稱重。
2. 加入Buffer QG（每100mg凝膠加Buffer QG 300μl），置50℃水浴10min。
3. 若回收片段小于500bp或大于4kb，則需加入異丙醇（每100mg凝膠加異丙醇100μl），混勻。
4. 將小柱放在2ml收集管上，將上述溶液加于柱上。
5. 4℃離心13000g×1min，棄去收集管中液體。
6. 加入500μl Buffer QG于柱上，4℃離心13000g×1min，棄去收集管中液體。
7. 加入750μl Buffer PE于柱上，4℃離心13000g×1min，棄去收集管中液體。
8. 4℃離心13000g×1min。棄去收集管。
9. 將柱放于一新1.5ml離心管上，加50μl EB于柱上。放置1min，4℃離心13000g×1min。
10. 取5μl 回收DNA電泳檢測。
三、 注意事項
紫外燈下切下含待回收DNA的凝膠時，要襯以干凈的塑料薄膜，使用無DNA污染的新刀片，其目的在于防止外源DNA的污染。