生物體各部分之間，在形態(tài)學(xué)上有等價(jià)的關(guān)系時(shí)，把這個(gè)關(guān)系稱為同源。是比較形態(tài)學(xué)的最基本概念。異種生物在體制上顯示同一配置的構(gòu)造中有某些共同點(diǎn)的器官，即使其機(jī)能和形態(tài)上有不同，也是等價(jià)的，應(yīng)該看作是同源。這個(gè)認(rèn)識(shí)是從圣希萊爾（E．Geoffroy Saint-Hilaire）等開(kāi)始的，他把這個(gè)關(guān)系用相當(dāng)于現(xiàn)在的相似的言詞去稱呼（The orie-des analogues）。把相似與同源區(qū)別開(kāi)來(lái)的是歐文（Owen，1843）。不久，同源被認(rèn)為是了解生物的系統(tǒng)發(fā)生、親緣關(guān)系的重要線索，因?yàn)橥雌鞴俦豢醋魇莵?lái)源于共同祖先的器官。同時(shí)，在同源的認(rèn)定上被加上了來(lái)源于同一胚層的胚胎學(xué)事實(shí)，以后又加上了對(duì)具有同樣發(fā)生能力的胚區(qū)，在同樣造形影響作用下所生成的器官互為同源的實(shí)驗(yàn)形態(tài)學(xué)的標(biāo)準(zhǔn)。但是，與此相反，同種器官來(lái)源于異種動(dòng)物的不同胚層的，也屢見(jiàn)不鮮。因而有人提倡同源應(yīng)該回到純粹的比較解剖學(xué)的定義上去（A．Remane．1956）。為了區(qū)別上述純形態(tài)學(xué)的、進(jìn)化的、實(shí)驗(yàn)形態(tài)學(xué)的三種同源，有的稱為形式同源、歷史同源、成因同源。而且，“同源”一詞，在比較同一個(gè)體的各部分時(shí)也逐慚被引用。這種同源稱為一般同源，以與上述特殊同源相區(qū)別。而一般同源被不同學(xué)者作種種分類，如格金鮑爾（K．Gegenbaur）把它分成（1）左右對(duì)稱器官間的同源（同型，例如脊椎動(dòng)物的左前肢與右前肢）。（2）沿體軸方向排列的部分間的同源（同價(jià)，例如脊椎動(dòng)物的前肢和后肢）。（3）同一器官的部分間的同源（同規(guī)，例如脊椎動(dòng)物前肢指間的同源）。（4）排列在體軸以外的方向的部分間的同源（同義，例如脊椎動(dòng)物的上腕骨與前腕骨）。并且同源的概念由上述以器官為主的關(guān)系擴(kuò)展到染色體組（相同染色體組）、染色體（同源染色體）和各種生物化學(xué)物質(zhì)（生化的同源）等等。