自交植物中采用的一種雜交育種,即從雜種的初期世代進行個體選擇,把下一代作為系統進行培育鑒別。一般是進行F2的個體選擇、F3的系統選擇和個體選擇,以及F4為F3系統、下代的系統群的選擇與系統選擇和個體選擇,F5以后可按同樣的操作進行。本法可詳細記錄系統的育種過程,育種家常根據后代的鑒定進行可靠的選擇,能很好地掌握選擇系統的特性。系統育種,作為有關育種目標性狀的基因數目不多,而且在性狀的遺傳價值較易判別時,系譜育種法是很有效的,能較快地取得育種成果。相反,在多基因遺傳的性狀中,此法往往有錯誤淘汰優良個體的危險,日本的水稻和小麥育種完全采用此法,但在高產品種的育種時,已趨向于采用群體育種法。