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病毒基因工程

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-06-28

1953WatsonCrick發(fā)現(xiàn)了DNA雙螺旋結(jié)構(gòu),開創(chuàng)了分子生物學的新時代。三十多年來有關(guān)DNA的研究有了飛躍的發(fā)展。基因工程就是指在試管內(nèi)人為地把DNA分子進行切割、拼接(即重組),再設(shè)法把它放回到細胞中去進行擴增,并表達產(chǎn)生人們所需要的蛋白。這樣就可以按照人們的意愿創(chuàng)造新的生命形態(tài),表現(xiàn)新的遺傳學特往。這種DNA重組技術(shù),不僅使基因研究在理論上有新的突破,而且產(chǎn)生了基因工程工業(yè)。它被認為是二十世紀生物學一項偉大的成就,也是當今第三次工業(yè)革命的重要組成部分。

病毒基因工程,就是指DNA重組技術(shù)在病毒學中的應(yīng)用。它是近十年來基于分子病毒學、分子生物學、微生物遺傳學以及細胞生理學的發(fā)展而形成的一個邊緣性的應(yīng)用科學領(lǐng)域。病毒基因工程技術(shù),不僅對病毒學本身規(guī)律的基礎(chǔ)研究十分重要,而且更主要的它又是研究病毒性疾病防治關(guān)鍵問題的一種必要手段。 

一、病毒學發(fā)展的三個階段

 

隨著生物學研究技術(shù)的不斷革新,病毒學的發(fā)展大致經(jīng)歷了如下三個階段。

(一)機體水平研究階段

40年代以前,病毒學工作者主要采用敏感動物(如小白鼠)或動物胚胎(如雞胚)來分離、鑒定病毒,研究病毒的繁殖、發(fā)病機理、兔疫反應(yīng)等,甚至使用受染動物組織制備疫苗,如狂犬病疫苗等。

(二)細胞水平研究階段

4060年代,由于組織培養(yǎng)技術(shù)廣泛應(yīng)用于病毒學領(lǐng)域,相繼分離了上百種過去對動物不敏感的新病毒,如腺病毒、副流感病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒、ECHO病毒等,大大擴展了病毒學研究的范圍。組織培養(yǎng)技術(shù)不僅為臨床病毒學的發(fā)展奠定了基礎(chǔ),而且還用于病毒復制和遺傳方面的研究,對病毒本質(zhì)有了進一步的認識。此外,一批經(jīng)濟、安全、有效的組織培養(yǎng)疫苗誕生了,如脊髓灰質(zhì)炎、麻疹、風疹、腮腺炎疫苗等,為預防病毒性疾病做出了貢獻。

(三)分子水平研究階段

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另一方面,分子病毒學的研究成果,對分子生物學的發(fā)展也起了很大的推動作用。RNA腫瘤病毒反轉(zhuǎn)錄酶的發(fā)現(xiàn),不僅充實了闡明DNA復制、轉(zhuǎn)錄和mRNA的翻譯表達及蛋白產(chǎn)物的結(jié)構(gòu)功能三者關(guān)系的中心法則,而且在實際應(yīng)用上,使RNA在試管內(nèi)反轉(zhuǎn)錄成cDNA成為可能。病毒基因結(jié)構(gòu)和表達的研究,還闡明了有關(guān)真核基因表達調(diào)控的某些原理,如基因重疊、間隙、內(nèi)含子的發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)錄后剪修,重復序列和增強子的存在等,都大大豐富了分子生物學的內(nèi)容。病毒載體的出現(xiàn),又為研究真核細胞基因表達提供了一個重要的手段。目前,分子病毒學還處于發(fā)展階段。

 

二、病毒基因工程的主要內(nèi)容和重要性

 

根據(jù)目前DNA重組技術(shù)的發(fā)展及分子病毒學研究的現(xiàn)狀和發(fā)展趨勢,病毒基因工程包括如下主要內(nèi)容。

(一)病毒基因組的克隆、結(jié)構(gòu)測定和表達

要研究病毒基因組的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,一般須先建立病毒基因組的無性繁殖系,這樣才能獲得足夠量的病毒DNA。后者可采用細菌質(zhì)粒、粘性質(zhì)粒或λ噬菌體作為載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌來完成。大的DNA病毒基因組可用限制性內(nèi)切酶切割成幾個片段進行克隆;RNA病毒可先在試管內(nèi)反轉(zhuǎn)錄成cDNA再進行克隆;反轉(zhuǎn)錄病毒基因組可克隆其前病毒DNA。建立了病毒基因組的無性繁殖系后,就可以采用化學法(Maxam et al 1977)或酶促法(Sanger et al 1977Messing et al 1981)測定病毒基因組的核苷酸序列,以了解基因的一級結(jié)構(gòu);結(jié)合在試管內(nèi)進行的轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)譯試驗,或基因缺失變異株的互補試驗等,就可逐步闡明其結(jié)構(gòu)和功能之間的關(guān)系,并了解基因表達調(diào)控的某些原理。在此基礎(chǔ)上,就可以設(shè)計組建病毒載體或表達病毒多肽。。

 

(二)病毒基因工程疫苗的研制

對產(chǎn)生中和抗體的病毒多肽基因高效表達的研究,導致了新一代病毒疫苗的誕生。鑒于動物病毒的自然宿主是動物細胞,所以動物病毒基因表達的模式與其他真核基因是類似的。眾所周知,真核基因與原核基因的表達調(diào)節(jié),在許多方面是不相同的(表12),其中最主要的是真核基因的不連續(xù)性,以及其調(diào)控信號不能為原核細胞正確識別。所以病毒基因在一般情況下,最好采用真核細胞系統(tǒng)來表達。也就是說,病毒基因工程疫苗要采用真核細胞系統(tǒng)來完成。可是,如果病毒基因先在試管內(nèi)從mRNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用原核細胞的啟動子,也可以在原核細胞中進行表達。目前,用于制備病毒基因工程疫苗的表達系統(tǒng)的種類和優(yōu)缺點詳見表13

 

病毒基因工程疫苗雖然還存在一些問題,但是與采用經(jīng)典方法生產(chǎn)的病毒疫苗相比較,仍有許多明顯的優(yōu)點:

1

2.

3

4

5

(三)抗病毒多肽物質(zhì)的研制

如表14所示,自1979年底以來,不少人和動物的干擾素基因已經(jīng)克隆成功。人

干擾素基因在原核細胞中已可高效表達,每升大腸桿菌菌液可以生產(chǎn)lmg干擾素,相當于23×108國際單位干擾素。采用DNA重組技術(shù)生產(chǎn)的干擾素具有與自然干擾素相同的生物學活性,目前已經(jīng)試用于臨床。采用基因工程技術(shù)還可以把幾個不同型別的干擾素基因拼接起來,生產(chǎn)具有不同性格的自然界所沒有的活性多肽物質(zhì),例如把αD-αA基因拼接后產(chǎn)生的干擾素,既具有具αD的某些性狀,又具有αA的一些性狀。所以DNA重組技術(shù)為生產(chǎn)人造抗病毒多肽物質(zhì)開辟了一條新途徑。

(四)動物病毒載體的組建

原核細胞系統(tǒng)的DNA重組技術(shù),對真核基因,包括動物病毒基因的克隆、鑒定,無疑是十分必要的,因為真核基因工程的起始步驟,多先在原核細胞內(nèi)完成。但是,正如表12所示,真核基因與原核基因的結(jié)構(gòu)與表達調(diào)節(jié)有很大的差別,要進行病毒基因或其他直接基因的表達調(diào)節(jié)研究,就必須建立一種真核基因工程系統(tǒng)。考慮到λ噬菌體載體(一種細菌的病毒)在大腸桿菌克隆系統(tǒng)中表現(xiàn)出很多優(yōu)點,許多學者也就對采用動物病毒作為真核細胞克隆和表達的載體,寄予很大的希望。可是,動物病毒與噬菌體各有許多不同的特點,在使用或改組動物病毒作為載體時,應(yīng)當注意下列問題:

1

但是,痘苗病毒基因組比較大,有較大的非必需區(qū),作為病毒載體是很有前途的。

2.

3

4

動物病毒載體的組建有兩種類型:第一是組建含有目的基因的感染性重組病毒,隨著病毒的繁殖,使目的基因有效表達。采用這一系統(tǒng)時,除反轉(zhuǎn)錄病毒外,大多數(shù)感染性病毒可以殺死細胞。第二是建立一種能使病毒載體復制的游離基因,其優(yōu)點是,可以用來建立不產(chǎn)生感染性病毒顆粒就可以不斷表達外源性基因的細胞系,而且還可以克服病毒顆粒包裝容量的限制。根據(jù)不同目的和要求,這兩類動物病毒載體各有其用處。

動物病毒載體的用途有如下幾方面:

1

2

3

4

 

三、病毒基因工程的主要環(huán)節(jié)

 

(一)供體DNA或外源性DNA

它可以通過提取、人工合成或從mRNA反轉(zhuǎn)錄獲得。由于大多數(shù)真核基因和病毒基因有插入順序,所以從mRNA反轉(zhuǎn)錄合成的cDNA往往不能完全代表真核基因的真正結(jié)構(gòu)。

(二)載體

載體也就是轉(zhuǎn)移外源性DNA片段的運載體,常用的有細菌質(zhì)粒、粘性質(zhì)粒、酵母質(zhì)粒、噬菌體或動物病毒。根據(jù)不同的目的和要求選用不同的載體系統(tǒng),也可不用載體把外源性DNA直接轉(zhuǎn)移到受體細胞中去。

(三)受體細胞

受體細胞就是指作為DNA重組體增殖或復制的宿主細胞。如果采用細菌時,要考慮到安全性。目前認為,大腸桿菌K12品系是安全的。如采用動物細胞來生產(chǎn)疫苗或其他活性多肽時,要考慮到潛在的致癌因子。

(四)重組體的改造與基因表達

外源性DNA與載體DNA的連接,以及重組體的改造大致有如下幾種方法:

1

2

3

4.

5

6

基因表達考慮的因素較多。總結(jié)病毒基因工程的主要環(huán)節(jié)如表1-5

.人工合成一個DNA片段,含有一定的酶切點以及所需要的序列。
.加上人工合成的接頭,造成一定的內(nèi)切酶粘性末端;
用末端轉(zhuǎn)移酶在3′端加上dAdT,或 dCdG后進行接連;
.使粘端修飾成平端,或用Bal 3l修飾后,再進行平端連接;
T4DNA 連接酶進行平端連接;
T4DNA 連接酶進行粘端連接;
.人類遺傳病的基因治療。
.利用病毒基因組中的基因表達增強子;
.高效表達真核基因,用于研制病毒疫苗或生產(chǎn)多種活性多肽物質(zhì);
.研究真核基因表達調(diào)控原理;
.在動物病毒載體中,要考慮基因表達增強子的作用。而在λ噬菌體,目前尚未見報道。
.在病毒載體中,目前還沒有有效的可以控制病毒基因轉(zhuǎn)錄的具體方法。而在λ噬菌體的克隆實驗中,可以采用λcIts857的溶原性細菌或帶有cIts857的質(zhì)粒來控制PL啟動子。采用這樣的系統(tǒng),就可以表達許多對細菌本身有毒性的多肽。
動物病毒作為載體,首先要求對該病毒的轉(zhuǎn)錄機制有清楚的了解。因為在大多數(shù)情況下,真核基因克隆的目的是要使插入基因能夠高效表達;而在λ或M13噬菌體的大多數(shù)工作中,基因克隆的目的大都是為了使外源性DNA進行擴增或者進行序列分析。
.作為載體的多數(shù)病毒基因的非必需區(qū)比較短。在設(shè)計λ噬菌體載體時,最簡單的途徑就是先確定一個對溶細胞性生長不必要的基因片段,然后在這一非必需區(qū)替代外源性DNA;在設(shè)計動物病毒載體時,外源性DNA往往代替了病毒基因的必需區(qū)。因此,重組病毒是絕對缺損性的,必須在輔助病毒存在的條件下才能繁殖,或者在染色體中已整合有輔助病毒基因的細胞中才能生長。再者,能夠作為感染性病毒繁殖的重組DNA分子大小,還要受到病毒顆粒包裝容量的限制,目前還沒有動物病毒的試管內(nèi)包裝系統(tǒng)。
.可以制備單一成分病毒疫苗,也可以制備同一病毒的多個成分的病毒疫苗。
.可以完全去除病毒基因中具有潛在危害性的部分,例如某些病毒的致癌基因;
.如采用重組病毒系統(tǒng),例如痘苗病毒,易于制備同一載體的多價病毒疫苗;
可以生產(chǎn)目前尚無敏感細胞的病毒疫苗,例如乙型肝炎病毒表面抗原疫苗;
.生產(chǎn)成本可以大幅度降低;
年代以來,分子生物學有了飛躍的發(fā)展,新技術(shù)、新方法的應(yīng)用,使病毒學的研究煥然一新。在這一時期內(nèi)基本上弄清了DNARNA病毒的繁殖機理,發(fā)現(xiàn)了一類亞病毒,建立了許多病毒基因組的無性繁殖系;闡明了某些病毒的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系和一些病毒的基因表達調(diào)控原理;搞清了有48502對核苷酸的λ噬菌體DNA的全結(jié)構(gòu)(Sanger et al 1982)以及許多動物病毒基因組的一級結(jié)構(gòu),甚至具有十幾萬對核苷酸的EB病毒基因組的序列分析也已完成(Epstein,個人通訊1984)。分子病毒學在理論上的迅速發(fā)展,給病毒性疾病的防治實踐帶來了新的突破。如果說,由受染動物組織制備的病毒疫苗為第一代產(chǎn)品;由受染組織培養(yǎng)細胞制備的為第二代;那么,采用DNA重組技術(shù)生產(chǎn)的病毒疫苗則為第三代。目前,口蹄疫病毒基因工程疫苗在進行動物實驗,乙型肝炎病毒疫苗也已經(jīng)研制成功。DNA重組技術(shù)不僅更新了病毒疫苗,對預防病毒性疾病將做出重大的貢獻;而且也使抗病毒治療發(fā)生了革命性的變化。例如,具有廣譜抗病毒活性的多肽物質(zhì)——干擾素,在我國也已經(jīng)可以采用基因工程技術(shù),由細菌發(fā)酵來生產(chǎn)(侯云德等198219831984)。DNA重組技術(shù)為生產(chǎn)新的多肽類藥物,開辟了一條新的途徑。
1892年ИBAHOCКИЙ發(fā)現(xiàn)病毒以來,病毒學在人類與病毒性疾病長期斗爭的實踐中,已逐步發(fā)展成為在生物學界和醫(yī)學界中一門十分重要的學科。鑒于象乙型肝炎、流行性出血熱、病毒性腦炎、病毒性肺炎、流行性感冒等一些病毒性疾病在我國還比較嚴重,所以病毒學在我國衛(wèi)生保健事業(yè)中占有十分重要的地位。

 
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