審查組開展現場審查工作主要包括以下5個基本程序：
    （1）召開首次會議。會議由審查組全體人員及被審查企業的領導和有關人員參加。會議由審查組組長主持，介紹審查組成員，說明審查的內容、審查計劃，并要求企業進行必要的協助；說明審查組的工作紀律，將“企業生產必備條件審查工作廉潔信息反饋表”交企業負責人，明確企業有權對審查工作組的廉潔性和公正性進行監督。企業領導介紹企業情況。
    （2）現場審查。現場審查的內容按“食品生產企業必備條件審查內容及要求”表中的內容進行審查。審查組成員按照分工同時開展工作，將審查結果記錄在“食品生產企業必備條件審查內容及要求”表中。表達方式為“符合”、“基本符合”、“不符合”、“暫不考核”4種。如果有的項目審查結果是“基本符合”或“不符合”，就要填寫“食品生產企業必備條件現場審查不符合項報告”表，在表中寫清楚是什么項目不符合或有不足，并由企業負責人簽字認可。同時要提出對不符合或有不足項的改進意見。
    （3）產品抽樣。抽樣的樣品應是企業的代銷產品，一般在成品庫內進行。樣品的抽樣方法、數量的等要求應按各類食品生產許可證實施細則中的規定進行。填寫產品抽樣單，樣品封好后，由企業到規定時間內安全送到指定的質檢機構。
    （4）審查組會議。確認審查記錄，核對審查記錄的完整性；對分歧意見的討論和處理；草擬審查報告和審查結論。
    （5）末次會議。現場具體審查工作完成以后，召開末次會議。會議由審查組全體成員及被審查的企業領導和有關工作人員參加。會議由審查組組長主持，與企業就審查情況進行溝通，指出不符合或不足的項目，向企業提出改進建議。