《食品生產許可證》的有效期一般為3年至5年，具體時間在各類《食品生產許可證實施細則》中予以規定。對于質量問題較為嚴重的、需要加強管理的食品，生產企業獲得的《食品生產許可證》有效期會短一些。例如，米、面、油、醬油、醋5類食品生產許可證實施細則規定，其生產許可證有效期均為3年。