在這一部分里，涉及到我們日常使用的常規的化學物質、不留意間釋放的工業或生活污染物以及天然存在的毒性物質。包括農藥殘留、獸藥殘留、食品添加劑、飼料添加劑、其它來源化學污染物以及天然毒素。

風險評估可以被視為系統地組織科學和技術信息的一種最基本的方法，以及與之相關的不確定性，都可以用來回答有關健康風險的一系列問題，提出解決國際貿易技術爭端的一些可行性方案。這要求評估相關信息，以及從那些信息中提取相關參數選擇相應模型。而且，要精確的考慮對于數據的收集以及知識運用的不確定性，以排除科學的似是而非性。

風險評估受數據和模型選擇的不確定性的支配。不確定度我們將在后面的章節中進一步討論。但在這里需要指出的是數據的不確定性同時來源于可用數據的有限性，以及對從流行病學和毒理學獲得數據的正確的評估和解釋。無論何時當我們試圖用數字描述某種條件下發生的某種現象時，就要用一些已知的條件推測來估計或預測那些不能獲得數據的有可能發生的現象，這就產生了模型的不確定性。

風險評估的過程中需要足夠的毒理學信息，而且這些信息要基于標準測試協議，并被國際組織接受。此外，一份可靠的風險評估要求要有已經被國際組織如：JECFA，JMPR，EPA，FDA，OECD 認可的數據，并且這些數據的量必須高于某一限值。

對于化學危害物而言，以經驗為基礎的毒理學解釋，作為風險評估是可行的。然而，到目前還沒有足夠復雜的科學信息可以提供一個非常高的確定度。當這里有許多動物毒理學數據可以使用，但是卻沒有足夠的數據可以最可能的預測人類的反應（如種、屬、毒性作用靶位）。結果，依靠在研究過程中可接受的最低劑量的毒性反應，就慢慢形成一種傳統。

風險評估所需要的最小量數據很難預先列出清單，以物質為基礎的危害數據、劑量-反應數據和暴露評估數據都會在很大程度上支配風險評估的范圍、規模和質量。在許多情況下，數據非常有限或者根本就不可能獲得。后者尤其適用于天然污染物和自然界存在物質的情況。當需要進行一項風險評估時，風險評估者就要對所需要的所有的信息進行最好的應用。并準確處理數據的不確定性。在某些得不到數據或其它不可能的情況下，風險評估者應當提供做出這種判斷的原因。一個正確的選擇將使問題在很少數據量下就得到解決。

風險評估過程中的其它事項包括使用默認設想來彌補知識和數據的缺乏。這將為確保不斷的進行風險評估并減少評估過程中的事事控制，以達到風險管理目標的預決定提供很大益處。然而，一個重要的不利因素就是由固有的條款代替科學判斷的潛在危害。一個折中的做法就是允許風險評估者在具體的化學評估中可以替換默認值，這樣做必須有可利用的相關科學數據支持。