中草藥害蟲種類繁多，除受一般農作物害蟲危害外，其本身還有一些特有害蟲。現簡要介紹如下：

（1）蚜、蚧、螨類等刺吸口器害蟲：蚜蟲是中草藥的重要害蟲類群，危害十分普遍。據調查桃蚜可危害數十種中草藥。中草藥還有一些特有的蚜蟲種類。如危害紅花、牛蒡等的紅花指官蚜Uroleucon gobonis（Matsumura）、危害蘿蘼科藥材的蘿蘼蚜Aphis asclepiadis Fitch等。介殼蟲主要危害一些南方生長的中草藥，尤其是木本南藥受害較重，如危害檳榔的椰圓盾蚧，危害多種中草藥的日本龜蠟蚧（Ceroplastes japonicus Green）等。少數中草藥受螨類危害較重，如危害地黃的棉葉螨，危害枸杞的癭螨（Eriophyes sp.）等。這類害蟲吸食中草藥汁液，造成黃葉、皺縮，葉、花、果脫落，嚴重影響中草藥生長和產量、質量。有些種類還是傳播病毒病的媒介，造成病毒病蔓延。由于發生量大，世代多，用藥水平較高，如何防止或減少農藥污染，是個值得重視的問題。

（2）地上部咀嚼口器害蟲：這類害蟲主要咀食中草藥葉、花、果等，造成孔洞或被食成光稈。如危害傘形科中藥的黃鳳蝶幼蟲，危害枸杞的枸杞負泥蟲（Lema decempunctata Gebler），危害板藍的青菜蟲等，危害都很嚴重。金銀花受尺蠖危害，幾天內可被吃光稈，造成嚴重損失。

（3）鉆蛀性害蟲：鉆蛀性害蟲是中草藥的一類危害重、防治難度較大，造成經濟損失較大的類群。危害中草藥的鉆蛀性害蟲主要有蛀莖性害蟲如金銀花咖啡虎天牛（Xylotrechus grayii White）、菊天牛、肉桂木蛾（Thymaiatris sp.）等；蛀根莖類害蟲如北沙參鉆心蟲（Epinotialancantha Meyrick）等；蛀花、果害蟲如檳榔紅脈穗螟（Tirathaba rufivena Walker）、枸杞實蠅等，蛀種子害蟲如黃芪種子小蜂（Bruchophagus spp.）等。

（4）地下害蟲：地下害蟲是主要危害植物地下部分又生活在土壤里的害蟲。地下害蟲種類很多，包括螻蛄、金針蟲、地老虎、根蛆、根蚜、根蚧、白蟻等，但以前四種危害最普遍。因中草藥中根部入藥者居多，地下害蟲直接危害藥用部位，致使商品規格下降，影響產量和質量。

2、中草藥病害的發生特點

（1）地道藥材病害嚴重：由于歷史形成的原因，使某些藥材有特定的被認為是最佳的生產地區。在這些地區生產的某種藥材就是所謂“地道藥材”。如東北人參、云南三七、寧夏枸杞、河南地黃、浙江杭菊、四川的川芎、甘肅當歸等。這些地道藥材長期生長在特定的地區。病原菌逐年積累，致使病害嚴重，難以控制。如東北人參銹腐十分嚴重，致使老參地下不能再利用，只有毀林栽參，已成一大難題。

（2）中草藥地下部病害嚴重：中草藥的藥用部位，很多是根、塊根和鱗莖等地下部分。這些地下部分很易受土傳病原真菌、細菌或線蟲危害，發生多種根部病害。如人參銹腐病、白術根腐病、附子白絹病、地黃線蟲病、漸貝軟腐病等。這類病害發生嚴重且難以控制，必須用以預防為主的綜合措施加以治理。

（3）無性繁殖材料是中草藥病害的重要初侵染來源：不少中草藥是用根、根莖、鱗莖、珠芽或枝條等無性繁殖材料進行繁殖的。這些無性繁殖材料常受到病害侵染而成為當代植株的病害初侵染來源。因此，在生產上建立無病苗種田，精選無病種苗進行適當的種苗處理和地區間種苗檢疫等工作是十分重要的防病措施。