被危害的植株表現為幼蟲鉆蛀于蔥心葉和葉鞘上蛀食葉肉和表皮，并形成灰白色不規則蜿蜒潛道，幼蟲在潛道中鉆行于蔥葉各處，危害葉脈，嚴重時會導致大蔥地上部干枯死亡。

　　一般潛葉蠅危害嚴重的地區，農業防治需考慮蔬菜布局，將潛葉蠅不危害的植物與大蔥套種。適當疏植，增加通透性。及時清理被潛葉蠅危害的病葉，將其深埋，燒毀或者漚肥。

　　藥物防治　可采用2%阿維菌素1000倍液等進行噴霧防治。另外不同時期的潛葉蠅需區別防治。在幼蟲2齡前（蟲道很小時），噴灑98%巴丹原粉1500～2000倍或1.8%愛福丁乳油3000～4000倍液，48%樂斯本乳油800～1000倍液，25%殺蟲雙水劑500倍液，98%殺蟲單可溶性粉劑800倍液，50%蠅蛆凈粉劑2000倍液；在成蟲羽化高峰的8～12小時施用5%銳勁特懸浮劑，5%抑太保乳油2000倍液，5%卡死克乳油2000倍液效果好。