1、農業防治。①清潔田園，減少菌源數量。②適當調整播種時期，使油菜初花期推遲，花期集中，有效控制菌核病的發生。③選好種子，培育無病壯苗。播種前用10%鹽水選種，淘除浮起來的病種子及小菌核，選好種晾干后播種。④優化種植密度。在一定范圍內適當降低油菜的種植密度，可使菌核病病情明顯減輕。⑤提高耕作水平。實行水旱輪作和寬行栽培有利于通風透氣，可降低發病；及時清溝理墑、中耕培土、排濕防漬，達到雨住溝干，降低田間濕度；盛花期及時清除黃老病葉，減少田間再侵染源。⑥合理施肥，防止倒伏。重施基肥和苗肥，避免薹花期大量施用氮肥造成徒長倒伏；氮肥在基肥中占50%比例，在苗肥中占20%-30%的比例為宜；積極采用配方施肥，增施磷肥、鉀肥和硼肥；油菜現蕾開花期噴施硼、錳、鉬、鋅等微量元素，具有防病增產效果。

    2、化學防治。①防治適期及防治次數。防治適期為油菜開花期，推薦次數2次，第1次防治時間選擇在油菜主莖開花株率達90%時進行，隔7天-10天開展第2次防治。②用藥方法。一是用好用足對口藥劑；二是提倡不同藥劑合理輪換使用，既可以有效延緩病菌抗病性的產生，又能提高防治效果；三是進行藥肥混噴，在防病的同提高油菜產量；四是大力推廣使用彌霧機和低容量噴霧，這樣藥液霧滴細、附著力強，能明顯提高農藥利用率和防治效果。③防治藥劑。主要對口藥劑有：50%農利靈可濕性粉劑、40%菌核凈可濕性粉劑、50%速克靈可濕性粉劑、80%的多菌靈超微粉、40%多硫懸浮劑、75%治萎靈、22%正大克菌靈、50%菜菌福、30%粉霉凈和50%萬霉靈等。

    3、抗病育種。利用芥菜和甘藍型油菜較抗病、白菜性油菜易感病的特點，選育抗病力強的甘藍型油菜品種。大力選育花歷期短、花期集中的高產優質雜交品種，同時積極進行抗油菜菌核病轉基因品種的研究。