食用菌同其他生物一樣都需要攝取一定的營養物質。屬異養性生物,自身不能合成養料,而是通過菌絲細胞表面的滲透作用,從周圍基質中吸收可溶性養料的。不同種類的食用菌攝取營養的方式不同,一般可分為腐生性、共生性、寄生性三種類型。
(一)腐生類型 大部分食用菌屬此類。他們以營腐生生活為方式,從正在分解或已經死亡的植物體以及無生活力的有機體上吸收養料,可分為木生型、土生型、糞草生型三個生態群。木生型食用菌主要生長在枯立木、倒木、樹樁及斷技上。土生型食用菌多生長在森林腐爛落葉層、牧場、草地、肥沃田野等特定生長場所。糞生型食用菌多生長在腐熟堆肥、廄肥以及腐爛草堆或有機廢料上。目前,進行商業性栽培的菇類幾乎都是腐生性菌類,但在實際生產中要根據它們的營養生理來選擇合適的培養料。
(二)共生類型 這類食用菌不能獨自在枯枝腐木上生長。它們需要的營養必需由活的松樹等植物來供給,由于植物和這些食用菌在營養上彼此有益,因此稱為共生菌。如菌根菌就是菌類與高等植物共生的代表,大多數森林蘑菇都是這種菌根菌。在食用菌中,不少種類能和高等植物、昆蟲、原生動物或其他菌類形成相互依存的共生關系。菇類菌絲能包圍在樹木根毛的外圍形成偽柔膜組織,稱為外生菌根,一部分菌絲可延伸到森林落葉層50厘米處,能幫助樹木吸收土壤中的水分和養料,并能分泌激素、刺激植物根系生長;樹木則能為菌根菌 提供光合作用所合成的碳水化合物。塊菌科、牛肝菌科、口蘑科、紅菇科、鵝育菌科的許多種類都是菌根菌。它們常和一定樹種形成共生關系。法國在橡樹林接種黑孢塊菌、日本在赤松林接種松口蘑。在熱帶和亞熱帶有近百種螞蟻能栽培蘑菇,這是昆蟲與菌類共生的一種自然現象。我國的雞隊菌就是與白蟻共生的食用菌。高等真菌之間也存在共生現象,金耳的子實體就是金耳與粗毛硬革所構成的復合體,銀耳和阿氏碳團共生。
(三)寄生類型 這類食用菌是完全寄生在活著的寄主主,從活著的寄主細胞中吸取養分。這種營寄生生活的種類非常稀少,大多數是兼性寄生類型,即兼備上述兩種類型,它們既可以在枯枝、禾草上生長,又能寄生于活的植物體上。如蜜環菌,它既能像香菇那樣在枯木上繁殖生長,又能侵入到天麻等植物的根內營寄生生活。多年層孔菌和層孔菌,都是寄生性菌類;能引起樹木的白色腐爛。食用菌的營養生理類型雖然不同,但歸根結底,它們都是從基質中攝取碳源、氮源、無機鹽和維生素等營養物質。