冬瓜產量高，栽培廣，每年收獲高峰時期，往往價格猛跌。貯藏是保證冬瓜長期供應，調節市場盈缺的重要手段。通過冬瓜的貯藏，即可延長冬瓜銷售供應期，淡季上市保值增值。貯藏的方法多樣，其中窖藏是比較簡便易行、貯藏時間較長的一種。冬瓜窖藏應注意以下幾點：

貯瓜的準備。冬瓜含水量較高，嫩瓜及過分成熟的瓜都不宜貯藏，所以貯藏的冬瓜要求九成熟，皮厚、肉厚，質地致密、品質較好，表面青皮發亮，布滿蠟質的品種。貯藏的瓜不能遭霜打，在生長期間應在瓜下墊磚或吊空，并防止日光曝曬，冬瓜在入庫之前要嚴防雨淋，采收時要留3～5厘米長的瓜秧。選擇天氣涼爽的早晨用剪刀剪摘。為防止瓜與瓜碰撞產生機械傷害，造成微生物侵染，用報紙包冬瓜。搬運過程中應輕拿輕放，嚴防擦傷、碰傷，特別注意應嚴防。

適貯的條件。冬瓜貯藏適宜條件：溫度為10℃～15℃，相對濕度為70%～75%，且通風良好。冬瓜在條件適宜時可保存數月。冬瓜不耐低溫貯藏，低于10℃會發生冷害；但貯存溫度過高，則呼吸速率加快，組織很快松軟，病原菌繁殖迅速，貯存期不長。

貯窖的準備。貯藏窖庫建造多以半地下方式，即建造窖室高約3.6米，地表上下面各建造1.8米，四周設有窖庫窗，并對開，以便于通風、換氣。貯藏窖的大小根據所貯冬瓜的數量決定。這種結構的建造，具有恒溫性高、涼爽、通風簡便、干濕度易控制的優良特點。在準備進行冬瓜入庫前2～3天，庫內應全面消毒滅菌，以高錳酸鉀煙霧熏蒸窖庫密閉處理以后，并把庫溫降至13℃，再將需要貯藏的冬瓜入庫。

窖藏方式。選擇經過嚴格挑選整齊、無破損的成熟冬瓜于庫內堆貯或架貯，最好使用架藏，單層擺放。架貯冬瓜因通風較好，相應比堆貯的要好，但架貯冬瓜也應在貯存架上先墊鋪干草等柔軟通風材料，然后再將冬瓜擺上去。采取堆放時，應先在庫底墊上干草或草簾，然后在上面擺放冬瓜，一般不超過3層，以免壓傷損壞。堆放時要留出通道，以便檢查。在擺放過程中，主張冬瓜地里怎么長，窖里怎么放，即根據冬瓜在田間生長時的狀態進行相同的狀態擺放，切不可錯置，因為瓜瓤已適應其重力作用方向，不易產生裂傷，貯藏時間便可以更長一些。

及時將病冬瓜周圍的冬瓜揀出單獨存放，并做好消毒處理。冬瓜貯藏期，只要能掌握好溫、濕度環境條件，一般均可貯藏3～4個月或更長時間。