1.腸炎病
病原 腸炎病又叫爛腸瘟、烏頭瘟。病原體為點狀產氣單孢桿菌。細菌為短桿狀，兩端圓形，單個或幾個相連，極端單鞭毛，有運動能力。
病癥 
病魚行動緩慢，不吃食，腹部膨大，體色變黑，特別是頭部顯得更黑，有很多體腔液，腸壁充血，呈紅褐色。腸內沒有食物，只有許多淡黃色的粘液。如不及時治療，病魚會很快死去。流行情況 
此病是目前飼養魚類中最嚴重的疾病之一。 在草、青魚中非常普遍，尤其是當年草魚和一齡的草、青魚最易得病。死亡率很高，一般可達50％左右。全國各養魚地區都有發生。各地的流行季節和發病程度，隨氣候的變化和飼養管理水平有所差異。在一年中，此病有兩個明顯的流行季節，5～6月主要是1～2齡草、青魚的發病季節，8～9月主要是當年草魚的發病季節，同時，該病往往與細菌性爛鰓病并發，流行地區十分廣泛。
防治方法
(1)每立方米水用1克漂白粉全池遍灑。
(2)喂大蒜頭：把大蒜頭搗爛，制成每0．5千克含大蒜100克的藥餌，每天投喂1次，連續投喂3天。
(3)喂磺胺胍：每50千克魚第1天用藥5克，第2～6天用藥2．5克，制成藥面投喂，每天喂1次，連續喂6天。
(4)每100千克魚，每天用魚復康a型250克拌飼料分上、下午2次投喂，連喂3天。二)寄生蟲引起的腸道病1.毛細線蟲病
病原 毛細線蟲病是由毛細線蟲寄生于魚的腸中而引起的魚病。蟲體線狀，肉眼可見。卵生，卵隨寄主糞便排入水中，沉入水底，或附在水草及碎屑上，被魚吞食后感染。
病癥 
蟲體以頭部鉆入宿主腸壁的粘膜層內，破壞腸壁組織，引起發炎，嚴重時可致死亡。少量寄生，不顯癥狀，感染4條以上蟲體，魚體即消瘦，體色變黑，離群獨游，長度1．7～6．6厘米的草、青魚種，平均感染強度達7．5條時， 能引起大量死亡。
流行情況 
主要危害草魚、青魚種，鰱、鳙、鯪魚也有感染。
防治方法
(1)徹底干塘，曝曬池底至干裂。
(2)用漂白粉與生石灰合劑清塘，每立方米水體用漂白粉10克，生石灰120克。
(3)發病初期，可用90％晶體敵百蟲，按每千克魚每天用0．1～0．15克，拌入豆餅粉30克，做成藥餌投喂，連喂6天，可有效地殺死腸內毛細線蟲。2.頭槽絳蟲病
病原 頭槽絳蟲病是由九江頭槽絳蟲、馬口頭槽絳蟲等引起的腸道寄生蟲病。九江頭槽絳蟲主要寄生于草、青、鰱、鳙、鯪等魚腸道內，馬口頭槽絳蟲主寄生于青魚、團頭魴、赤眼鱒等魚腸道內。頭槽絳蟲為扁帶形，由許多節片組成，頭節略呈心臟形，頂端有頂盤，兩側有兩個深溝槽，無明顯頸部。每個體節片內均有一套雌雄生殖器官，睪丸不球形，成單行排列在髓層。卵巢塊狀雙葉腺體。卵黃腺散布在皮層。成熟節片內充滿蟲卵。頭槽絳蟲卵隨著糞落入水中，孵出鉤球蚴，為魚類誤食后，即在魚腸道中發育為裂頭蚴，并陸續長出節片發育成成蟲。病癥 
病魚黑色素增加，口常張開，但食量劇減，故又稱“干口病”。嚴重的病魚，腹部膨脹，剖開魚腹，可見腸道形成胃囊狀擴張，破腸后，即可見到白色帶狀蟲體聚集在一起。
流行情況 
此病主要危害草魚種。流行地區主要在廣東、廣西，越冬草魚種死亡率達90％，是主要魚病之一。
防治方法
(1)徹底清塘，殺滅劍水鳋。
(2)用含90％的晶體敵百蟲50克和面粉500克混合做成藥餌，按魚定量投喂，每天1次，連喂6天。
(3)每萬尾魚種，用南瓜子250克研成粉漿，拌入0．5千克米糠投喂，每天1次，連喂3天。
(4)每千克魚用48毫克吡喹酮拌飼料投喂1次，隔4天用同樣劑量再投喂1次。3.變形蟲病
病原 為鯇內變形蟲引起的一種腸道病。營養體淡灰色，運動活潑，胞質分內外兩層，內質比較濃密，具細小空泡，外質透明，能不斷伸出葉狀偽足，使蟲體向前推進。細胞核透明、圓形。當環境不良時，偽足消失，體積變小，不活動也不攝食，分泌一層薄膜把身體包圍，形成胞囊，隨寄主糞便排出體外，被魚吞食而感染。
病癥 
鯇內變形蟲寄生在腸內，由于腸粘膜組織遭到破壞，充血發炎，出現乳黃色粘液，因此與細菌性腸炎病有些相似，但無細菌性腸炎的其他癥狀。常與六鞭毛蟲、腸袋蟲同時存在，或與細菌性腸炎形成并發癥。流行情況 
鯇內變形蟲主要寄生在2齡以上草魚的后腸，長江中下游和西江流域各養魚地區都有分布，但以兩廣地區流行最普遍，6～9月為流行季節，且常與細菌性腸炎病同時暴發。
防治方法
(1)可采用生石灰清塘等措施，以殺滅落在水中的胞囊。
(2)加強魚池的衛生管理，防止有病原體的水流或其他媒介物把病原體帶入池中。