國際酶學委員會（I.E.C）規定，按酶促反應的性質，可把酶分成六大類：

　　1.氧化還原酶類（oxidoreductases）指催化底物進行氧化還原反應的酶類。例如，乳酸脫氫酶、琥珀酸脫氫酶、細胞色素氧化酶、過氧化氫酶等。

　　2.轉移酶類（transferases）指催化底物之間進行某些基團的轉移或交換的酶類。如轉甲基酶、轉氨酸、己糖激酶、磷酸化酶等。

　　3.水解酶類（hydrolases）指催化底物發生水解反應的酶類。例如、淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、磷酸酶等。

　　4.裂解酶類（lyases）指催化一個底物分解為兩個化合物或兩個化合物合成為一個化合物的酶類。例如檸檬酸合成酶、醛縮酶等。

　　5.異構酶類（isomerases）指催化各種同分異構體之間相互轉化的酶類。例如，磷酸丙糖異構酶、消旋酶等。

　　6.合成酶類（連接酶類，ligases）指催化兩分子底物合成為一分子化合物，同時還必須偶聯有ATP的磷酸鍵斷裂的酶類。例如，谷氨酰胺合成酶、氨基酸：tRNA連接酶等。

　　二、酶的命名

　　（一）習慣命名法

　　1.一般采用底物加反應類型而命名，如蛋白水解酶、乳酸脫氫酶、磷酸己糖異構酶等。

　　2.對水解酶類，只要底物名稱即可，如蔗糖酶、膽鹼酯酶、蛋白酶等。

　　3.有時在底物名稱前冠以酶的來源，如血清谷氨酸－丙酮酸轉氨酶、唾液淀粉酶等。

　　習慣命名法簡單，應用歷史長，但缺乏系統性，有時出現一酶數名或一名數酶的現象。

　　（二）系統命名法

　　鑒于新酶的不斷發展和過去文獻中對酶命名的混亂，國際酶學委員會規定了一套系統的命名法，使一種酶只有一種名稱。它包括酶的系統命名和4個數字分類的酶編號。例如對催化下列反應酶的命名。

　　ATP+D—葡萄糖→ADP+D—葡萄糖-6-磷酸

　　該酶的正式系統命名是：ATP：葡萄糖磷酸轉移酶，表示該酶催化從ATP中轉移一個磷酸到葡萄糖分子上的反應。它的分類數字是：E.C.2.7.1.1，E.C代表按國際酶學委員會規定的命名，第1個數字（2）代表酶的分類名稱（轉移酶類），第2個數字（7）代表亞類（磷酸轉移酶類），第3個數字（1）代表亞亞類（以羥基作為受體的磷酸轉移酶類），第4個數字（1）代表該酶在亞-亞類中的排號（D葡萄糖作為磷酸基的受體）。