微生物實驗是主要針對微生物的分離、培育、育種、鑒別、形態、變異、利用、危害等方面進行實驗和研究。

一、微生物實驗室組成

微生物實驗室組成一般包括：準備室、微生物培養室、器械消毒及清洗室、純水室、檢測室、菌種室、儲藏室等。微生物實驗室根據工作領域（食品、醫療、藥品）和性質（教學、研究、生產、監測等）實驗室組成和規模有很大差別。

二、微生物實驗室平面布局

微生物實驗室應設置成獨立的區域，與其他實驗室分開，門口應設有門禁，非相關人員不可進入，各室根據工作內容合理布局，既方便工作又互不影響。入口處設置集中式更衣室，培養室根據培養條件和種類不同可設置多間（如細菌培養室、霉菌培養室、液體培養室、固體培養室等）。

1．潔凈實驗室：

自成一區，安排在實驗室的靠邊角落處，用密封門限值人員的進出，把有潔凈要求的房間設置在人員干擾少的地方，把輔助房間設置在外部。考慮微生物試驗操作流程，把檢測室與洗刷消毒室和培養室相鄰，方便人流與物流的分離。為控制人員的出入，只設有一個密封門進入微生物實驗室主潔凈區，操作人員進入走廊然后進入準備間，并從準備間分別經過一更、二更、緩沖進入操作區。物流則從傳遞窗實現。排風口裝有高效過濾器，送風口裝有高效過濾靜壓箱，室內送排風采用上送下排的方式，室內排風單側布置，不得有障礙。余壓閥自動調節室內壓力，保持正壓潔凈狀態。

2．培養箱：

主要配置各種培養箱、搖床、要求溫度較恒定，有足夠的電力供應。

3．準備室：

設實驗臺、試劑柜等要絕緣、耐熱、實驗臺要耐水耐腐蝕；設置山下水裝置，設計粉碎、分篩等操作，須配置相應的設備。局部排風，設排風柜。

4．洗滌室：

洗滌室房間尺寸根據日常工作決定，一般不小于一個單間，洗滌室的位置應靠近培養室，給排水設施完善，洗滌臺面須耐熱耐酸，室內配器皿柜、滴水架、干燥架、邊臺等，地面應有良好的排水坡度和地漏。

三、微生物實驗室常用設備

1．制冰機。

2．定氮裝置

3．細菌鑒定系統。

4．顯微圖像分析系統。

5．點蒸餾水器、超純水機。

6．電導率儀：主要用于測水質。

7．酸度計：用于溶液PH值測定。

8．干燥箱：電熱干燥箱、真空干燥箱。

9．離心機：低速離心機、臺式高速離心機。

10．滅菌器：高壓蒸汽滅菌鍋、干熱滅菌器。

11．天平：±0.1mg分析、±10mg電子天平。

12．恒溫水浴鍋、攪拌器、超聲波清洗機、電熱板。

13．冰箱：低溫冰箱、超低溫冰箱、普通冰箱、立式冷藏柜等。

14．分光光度計：可見分光光度計、紫外分光光度計、用于定量分析。

15．顯微鏡：生物顯微鏡、體式顯微鏡、熒光顯微鏡、倒置顯微鏡等。

16．培養箱：電熱恒溫培養箱、隔水式恒溫培養箱、生化培養箱、恒溫恒濕箱、厭氧培養箱、光照培養箱等。

17．無菌室和超凈工作臺是實驗室的核心部分，主要為樣品提供保護，保證實驗結果的準確。無菌室通過空氣的凈化和空間的消毒為微生物實驗室提供一個相對無菌的工境。

無菌室中的主要設備包括：傳遞窗、紫外線燈、嚴格的無菌室裝備風室、超凈工作臺。超凈工作臺使用簡單方便，根據風向分為水平流和垂直流。