厭氧菌（anaerobic bacteria）是指無氧或氧化還原電勢低的條件下才能生長繁殖的一類細菌。這類細菌由于缺乏完善的酶系統，因此只能以無氧發酵進行能量代謝。

厭氧菌在自然界分布廣泛，包括環境、土壤、水源和動物中。其中，人體本身也有眾多的厭氧菌，大多存在于人體和動物的皮膚、腔道的深部黏膜表面。

正常情況下，大多數厭氧菌對人體無害，只有當組織缺血、壞死或者需氧菌感染等情況下，會誘發感染，從而造成腹腔內感染、牙周炎及婦科炎癥、外傷及上呼吸道感染等一系列疾病。

根據對厭氧的耐受程度不同，可將被分為三大類：

（1）對氧極端敏感的厭氧菌：這類細菌對厭氧條件要求很高，在空氣中暴露10min即死亡，臨床上很難分離出。

（2）中度厭氧菌：此類厭氧菌較為常見，在相應的技術條件下，容易被分離出，即使在空氣中暴露60～90min或在膿汁抽出72h后仍然能被分離出來。

（3）耐氧厭氧菌：這類細菌不能利用氧，在無氧條件下生長好，而在有氧條件下生長不佳。

破傷風梭狀芽胞桿菌
破傷風梭狀芽胞桿菌（Clostridium etani）是引起破傷風的病原菌，為革蘭氏陽性厭氧菌，長 4～8μm，寬 0.3～0.5μm。它以芽胞形式廣泛分布于自然界中，如泥土、人畜腸道、糞便、皮膚和銹器表面等。

在缺氧環境中，破傷風桿菌芽胞發育為增殖體，迅速繁殖并產生大量破傷風溶血毒素和破傷風痙攣毒素。前者可引起局部組織的壞死和心肌損害；后者是一種神經毒素并導致了破傷風的主要臨床癥狀，是目前已知的最強的毒素之一，人類最小致死劑量僅為2.5ng/Kg。
產氣莢膜梭狀芽胞桿菌

產氣莢膜桿菌(Clostridium perfringen)，為梭狀芽胞桿菌類屬，是厭氧、無動力、能產生芽胞的革蘭氏陽性粗大桿菌，單獨或成雙排列，兩段鈍圓，芽孢大，卵圓形，位于次端，在機體內可形成莢膜。

產氣莢膜梭菌屬于人和動物腸道內正常菌群的成員，是腸道內的條件致病菌，正常情況下不致病，當機體受到飲食、藥物、微生物、環境因素等影響及自身生理狀態發生變化時，腸道菌群平衡會遭到破壞，導致腸道功能紊亂，此時產氣莢膜梭菌過度繁殖，使腸道正常菌群受到抑制，并產生外毒素。由于該菌存在于人糞及溫血動物的糞便內，可作為糞便污染水體和土壤的指示菌。

肉毒梭狀芽胞桿菌

肉毒梭狀芽孢桿菌（Clostridium botulinum），是革蘭氏陽性厭氧芽孢桿菌，鞭毛無莢膜， 廣泛分布于自然界、土壤、海洋、湖泊沉積物以及人畜糞便中。該菌在自然界中生命力頑強，在干燥環境中可存活數十年之久，在有氧狀態下，一般沒有致病性。在厭氧環境下，會分泌一種毒力作用強烈的神經外毒素， 即肉毒桿菌毒素，其毒性超過任何其他已知的天然毒素，0.1-1μg就可以引起人類中毒死亡。

肉毒梭菌常會污染、滋生于臘腸、火腿、魚及魚制品和罐頭等食品，又因其芽孢耐熱，一般煮沸需經1～6h，或121℃高壓蒸汽4～10min才能殺死，易引起食物中毒。目前，在食品行業中，罐頭的殺菌效果一般以肉毒梭菌為指示細菌。

艱難梭狀芽胞桿菌

艱難梭狀芽孢桿菌(Clostridium difficile)又稱艱難梭菌，為嚴格的專性厭氧型細菌，無莢膜，革蘭染色陽性粗長桿菌，培養2天后有轉為革蘭陰性的趨向。主要分布于土壤、水、干草、沙、動物和人的糞便中，此外還大量存在嬰兒的腸道中，是新生兒腸道中正常菌群。該菌可引起腎盂腎炎、腦膜炎、腹腔及陰道感染、菌血癥和氣性壞疽等，目前是醫院內感染的病原菌之一。

牙齦卟啉單胞菌

牙齦卟啉單胞菌（Porphyromonas gingivalis）是一種與成人牙周炎關系密切的專性厭氧革蘭氏陰性球桿菌，也是導致慢性牙周炎最為典型的一種革蘭氏陰性厭氧菌，無糖分解特性但具有蛋白分解特性。牙齦卟啉單胞菌存在于健康人群中，并且被認為是宿主適應性病原體，只有當宿主和細菌之間的生態平衡遭到破壞后，才能引起致病。同時，該菌也可能參與調節菌斑生物膜的發展，協調和控制其病理生理機制，以減少對宿主的損害。

志賀氏菌

志賀氏菌（Shigella）通稱痢疾桿菌，是一類兼性厭氧型革蘭氏陰性短小桿菌，耐寒，能分解葡萄糖，產酸但不產氣。根據其抗原構造的不同，可分為痢疾、福氏、鮑氏和宋內志賀氏菌四群，共48個血清型。志賀氏菌是人類細菌性痢疾最為常見的病原菌，主要流行于發展中國家，全世界年病例數超過2億。在我國，志賀氏菌食物中毒，主要是由宋內氏志賀菌引起，經糞-口途徑進行傳播。此類中毒多發生在夏秋季，由飲水、熱肉制品等引起。

乳酸桿菌

乳酸桿菌(Lactobacillus)是一群桿狀或球狀的革蘭氏陽性菌，因量乳酸而發酵糖產生大命名。其存在廣泛，嗜酸性，在pH為3~6的環境中均能生存，是無芽胞桿菌中是耐酸力最強的，一般在厭氧條件下繁殖。該類群細菌分布廣泛，動物和人類從口腔到直腸始終都有該菌存在，且絕大多數對動物和人無毒、無害，負擔著動物體內重要的生理功能。

研究表明，乳酸桿菌具有抑制病原菌、抗感染、維持腸道的微生態平衡、預防和抑制腫瘤的發生、增強機體免疫力、促進消化、合成氨基酸和維生素、降低膽固醇、抑制內毒素的生產、延緩衰老等功效。

雙歧桿菌

雙歧桿菌（Bifidobacterium）是一個細菌屬名，是一類革蘭氏陽性、不運動、細胞呈桿狀、一端有時呈分叉狀、嚴格厭氧的細菌。廣泛存在于人和動物的消化道、陰道和口腔等生境中，是人和動物腸道菌群的重要組成成員之一，也是一類重要的腸道有益微生物。

研究表明，雙歧桿菌能抑制人體有害細菌的生長，抵抗病原菌的感染，合成人體需要的維生素，促進人體對礦物質的吸收，產生醋酸、丙酸、丁酸和乳酸等有機酸刺激腸道蠕動，促進排便，防止便秘以及抑制腸道腐敗作用、凈化腸道環境、分解致癌物質、刺激人體免疫系統，從而提高抗病能力等方面有著重要作用。

幽門螺旋桿菌

幽門螺旋桿菌（Helicobacter pylori）是一種革蘭氏陰性桿菌，螺旋形、微需氧、對生長條件要求十分苛刻。目前，該菌是消化系統最常見的感染病菌，全球平均感染率約50%，在一些發展中國家感染率甚至可達到70%左右，被認為是世界上最廣泛的感染之一。幽門螺旋桿菌主要分布在胃粘膜組織中，是導致胃部多種疾病發生的一大誘因，嚴重時引發癌變，因此是目前臨床醫學中的重點檢查對象。

彎曲桿菌

彎曲桿菌（Campylobacter），呈逗點狀或S形，微需氧，革蘭氏陰性細菌。彎曲菌屬中有10余種可導致人類疾病，其中最常見的是空腸彎曲菌和結腸彎曲菌，占人彎曲菌感染的90%。彎曲菌在禽類、畜類等動物中廣泛分布，該菌主要定居于禽類、畜類等動物的腸道內，也是人畜共患病的病原菌之一。目前，空腸彎曲菌是人類常見的食源性病原菌，感染后主要引起急性腸炎，嚴重時會引發格林巴利綜合癥，嚴重危害人類健康，因此，該菌正受到越來越受人們廣泛關注。